Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHAF1BQ13112 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHAF1BQ13112 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHAF1BQ13112 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHAF1BQ13112 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHAF1BQ13112 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHAF1BQ13112 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHAF1BQ13112 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHAF1BQ13112 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHAF1BQ13112 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHAF1BQ13112 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHAF1BQ13112 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CHAF1BQ13112 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHAF1BQ13112 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHAF1BQ13112 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHAF1BQ13112 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHAF1BQ13112 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHAF1BQ13112 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHAF1BQ13112 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHAF1BQ13112 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHAF1BQ13112 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHAF1BQ13112 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHAF1BQ13112 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHAF1BQ13112 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHAF1BQ13112 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHAF1BQ13112 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHAF1BQ13112 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHAF1BQ13112 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHAF1BQ13112 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHAF1BQ13112 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHAF1BQ13112 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHAF1BQ13112 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHAF1BQ13112 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHAF1BQ13112 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHAF1BQ13112 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHAF1BQ13112 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHAF1BQ13112 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHAF1BQ13112 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHAF1BQ13112 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHAF1BQ13112 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHAF1BQ13112 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHAF1BQ13112 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHAF1BQ13112 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHAF1BQ13112 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHAF1BQ13112 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHAF1BQ13112 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHAF1BQ13112 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHAF1BQ13112 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHAF1BQ13112 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHAF1BQ13112 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CHAF1BQ13112 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHAF1BQ13112 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHAF1BQ13112 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHAF1BQ13112 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHAF1BQ13112 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHAF1BQ13112 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHAF1BQ13112 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHAF1BQ13112 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHAF1BQ13112 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CHAF1BQ13112 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHAF1BQ13112 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHAF1BQ13112 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHAF1BQ13112 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHAF1BQ13112 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHAF1BQ13112 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHAF1BQ13112 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHAF1BQ13112 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHAF1BQ13112 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHAF1BQ13112 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHAF1BQ13112 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHAF1BQ13112 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHAF1BQ13112 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHAF1BQ13112 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHAF1BQ13112 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHAF1BQ13112 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHAF1BQ13112 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHAF1BQ13112 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHAF1BQ13112 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHAF1BQ13112 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHAF1BQ13112 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHAF1BQ13112 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHAF1BQ13112 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHAF1BQ13112 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHAF1BQ13112 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHAF1BQ13112 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHAF1BQ13112 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHAF1BQ13112 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHAF1BQ13112 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHAF1BQ13112 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHAF1BQ13112 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHAF1BQ13112 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHAF1BQ13112 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHAF1BQ13112 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHAF1BQ13112 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHAF1BQ13112 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHAF1BQ13112 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHAF1BQ13112 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHAF1BQ13112 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHAF1BQ13112 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHAF1BQ13112 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
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