Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ECH1Q13011 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ECH1Q13011 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ECH1Q13011 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ECH1Q13011 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ECH1Q13011 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ECH1Q13011 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ECH1Q13011 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ECH1Q13011 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ECH1Q13011 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ECH1Q13011 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ECH1Q13011 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ECH1Q13011 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ECH1Q13011 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ECH1Q13011 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ECH1Q13011 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ECH1Q13011 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ECH1Q13011 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ECH1Q13011 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ECH1Q13011 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ECH1Q13011 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ECH1Q13011 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ECH1Q13011 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ECH1Q13011 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ECH1Q13011 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ECH1Q13011 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ECH1Q13011 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ECH1Q13011 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ECH1Q13011 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ECH1Q13011 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ECH1Q13011 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ECH1Q13011 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ECH1Q13011 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ECH1Q13011 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ECH1Q13011 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ECH1Q13011 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ECH1Q13011 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ECH1Q13011 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ECH1Q13011 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ECH1Q13011 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ECH1Q13011 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ECH1Q13011 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ECH1Q13011 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ECH1Q13011 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ECH1Q13011 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ECH1Q13011 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ECH1Q13011 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ECH1Q13011 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ECH1Q13011 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ECH1Q13011 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ECH1Q13011 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ECH1Q13011 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ECH1Q13011 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ECH1Q13011 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ECH1Q13011 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ECH1Q13011 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ECH1Q13011 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ECH1Q13011 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ECH1Q13011 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ECH1Q13011 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ECH1Q13011 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ECH1Q13011 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ECH1Q13011 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ECH1Q13011 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ECH1Q13011 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ECH1Q13011 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ECH1Q13011 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ECH1Q13011 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ECH1Q13011 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ECH1Q13011 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ECH1Q13011 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ECH1Q13011 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ECH1Q13011 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ECH1Q13011 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ECH1Q13011 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ECH1Q13011 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ECH1Q13011 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ECH1Q13011 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ECH1Q13011 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ECH1Q13011 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ECH1Q13011 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ECH1Q13011 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ECH1Q13011 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ECH1Q13011 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ECH1Q13011 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ECH1Q13011 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ECH1Q13011 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ECH1Q13011 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ECH1Q13011 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ECH1Q13011 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ECH1Q13011 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ECH1Q13011 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ECH1Q13011 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ECH1Q13011 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ECH1Q13011 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ECH1Q13011 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ECH1Q13011 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ECH1Q13011 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ECH1Q13011 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ECH1Q13011 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
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