Protein–RNA interactions for Protein: Q12874

SF3A3, Splicing factor 3A subunit 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A3Q12874 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.183e-11■■■■■ 74.1
SF3A3Q12874 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.173e-11■■■■■ 74.1
SF3A3Q12874 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.113e-11■■■■■ 74.1
SF3A3Q12874 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.093e-11■■■■■ 74.1
SF3A3Q12874 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.013e-11■■■■■ 74.1
SF3A3Q12874 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.023e-11■■■■■ 74.1
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SF3A3Q12874 BSG-206ENST00000572899 582 ntTSL 214.56□□□□□ -0.082e-21■■■■■ 74.1
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SF3A3Q12874 BSG-207ENST00000573216 545 ntTSL 413.97□□□□□ -0.172e-21■■■■■ 74.1
SF3A3Q12874 DOCK6-203ENST00000585904 554 ntTSL 413.59□□□□□ -0.233e-11■■■■■ 74.1
SF3A3Q12874 SYNGR2-209ENST00000592456 3036 nt13.49□□□□□ -0.253e-11■■■■■ 74.1
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SF3A3Q12874 GOLGA2-205ENST00000462089 766 ntTSL 310.86□□□□□ -0.673e-11■■■■■ 74.1
SF3A3Q12874 DOCK6-211ENST00000590452 231 ntTSL 39.39□□□□□ -0.913e-11■■■■■ 74.1
SF3A3Q12874 TNPO3-203ENST00000471234 3283 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.913e-11■■■■■ 74.1
SF3A3Q12874 TNPO3-204ENST00000482320 3585 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.913e-11■■■■■ 74.1
SF3A3Q12874 TNPO3-205ENST00000627585 4514 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.933e-11■■■■■ 74.1
SF3A3Q12874 TNPO3-201ENST00000265388 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.953e-11■■■■■ 74.1
SF3A3Q12874 RPS19-208ENST00000601492 342 ntTSL 56.71□□□□□ -1.343e-11■■■■■ 74.1
SF3A3Q12874 REV1-208ENST00000472000 778 ntTSL 26.66□□□□□ -1.343e-11■■■■■ 74.1
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SF3A3Q12874 REV1-204ENST00000438366 545 ntTSL 34.09□□□□□ -1.753e-11■■■■■ 74.1
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SF3A3Q12874 ATP2A1-202ENST00000395503 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.362e-7■■■■■ 72.7
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SF3A3Q12874 ZNF317-202ENST00000360385 3955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.732e-6■■■■■ 71.7
SF3A3Q12874 ZNF317-204ENST00000590152 2312 ntTSL 210.02□□□□□ -0.812e-6■■■■■ 71.7
SF3A3Q12874 ZNF317-201ENST00000247956 4073 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.882e-6■■■■■ 71.7
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SF3A3Q12874 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC1.66□□□□□ -2.141e-323■■■■■ 70.6
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SF3A3Q12874 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.276e-12■■■■■ 70.4
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SF3A3Q12874 RNASEK-209ENST00000575822 613 ntTSL 316.16■□□□□ 0.186e-12■■■■■ 70.4
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SF3A3Q12874 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.356e-12■■■■■ 70.4
SF3A3Q12874 RNASEK-208ENST00000570898 425 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.716e-12■■■■■ 70.4
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SF3A3Q12874 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.542e-10■■■■■ 69.2
SF3A3Q12874 APEH-216ENST00000491799 733 ntTSL 318.07■□□□□ 0.482e-10■■■■■ 69.2
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SF3A3Q12874 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.382e-10■■■■■ 69.2
SF3A3Q12874 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.362e-10■■■■■ 69.2
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SF3A3Q12874 APEH-211ENST00000463995 1024 ntTSL 516.28■□□□□ 0.22e-10■■■■■ 69.2
SF3A3Q12874 APEH-209ENST00000462439 829 ntTSL 215.92■□□□□ 0.142e-10■■■■■ 69.2
SF3A3Q12874 PI4KA-207ENST00000466772 3109 ntTSL 215.33■□□□□ 0.052e-10■■■■■ 69.2
SF3A3Q12874 RNF40-206ENST00000564260 768 ntTSL 215.17■□□□□ 0.022e-10■■■■■ 69.2
SF3A3Q12874 EFTUD2-214ENST00000589769 689 ntTSL 314.89□□□□□ -0.032e-10■■■■■ 69.2
SF3A3Q12874 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.042e-10■■■■■ 69.2
SF3A3Q12874 NRBP1-206ENST00000460499 2561 ntTSL 214.8□□□□□ -0.042e-10■■■■■ 69.2
SF3A3Q12874 PI4KA-202ENST00000399213 1636 ntTSL 514.79□□□□□ -0.042e-10■■■■■ 69.2
SF3A3Q12874 APEH-208ENST00000457042 853 ntTSL 514.56□□□□□ -0.082e-10■■■■■ 69.2
SF3A3Q12874 APEH-210ENST00000463616 699 ntTSL 314.56□□□□□ -0.082e-10■■■■■ 69.2
SF3A3Q12874 APEH-205ENST00000447436 963 ntTSL 514.46□□□□□ -0.092e-10■■■■■ 69.2
SF3A3Q12874 LAMA5-208ENST00000474128 579 ntTSL 314.42□□□□□ -0.12e-10■■■■■ 69.2
SF3A3Q12874 AJAP1-202ENST00000378191 11666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.142e-10■■■■■ 69.2
SF3A3Q12874 APEH-207ENST00000449966 825 ntTSL 314.12□□□□□ -0.152e-10■■■■■ 69.2
SF3A3Q12874 APEH-203ENST00000442186 924 ntTSL 514.12□□□□□ -0.152e-10■■■■■ 69.2
SF3A3Q12874 QSOX1-202ENST00000367602 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.182e-10■■■■■ 69.2
SF3A3Q12874 PI4KA-209ENST00000477245 3026 ntTSL 1 (best)13.94□□□□□ -0.182e-10■■■■■ 69.2
SF3A3Q12874 PI4KA-217ENST00000492581 3925 ntTSL 213.08□□□□□ -0.322e-10■■■■■ 69.2
SF3A3Q12874 MEGF8-202ENST00000334370 10966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.342e-10■■■■■ 69.2
SF3A3Q12874 MEGF8-203ENST00000378073 11034 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.442e-10■■■■■ 69.2
SF3A3Q12874 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.442e-10■■■■■ 69.2
SF3A3Q12874 APEH-204ENST00000446089 855 ntTSL 512.23□□□□□ -0.452e-10■■■■■ 69.2
SF3A3Q12874 APEH-215ENST00000483715 1055 ntTSL 311.88□□□□□ -0.512e-10■■■■■ 69.2
SF3A3Q12874 RUVBL2-205ENST00000595002 546 ntTSL 211.15□□□□□ -0.622e-10■■■■■ 69.2
SF3A3Q12874 ACTN1-219ENST00000556432 558 ntTSL 1 (best)11.12□□□□□ -0.632e-10■■■■■ 69.2
SF3A3Q12874 CERK-204ENST00000471929 567 ntTSL 48.99□□□□□ -0.972e-10■■■■■ 69.2
Retrieved 100 of 27,864 protein–RNA pairs in 544.9 ms