Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
NFIAQ12857 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
NFIAQ12857 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
NFIAQ12857 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
NFIAQ12857 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
NFIAQ12857 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
NFIAQ12857 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
NFIAQ12857 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
NFIAQ12857 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
NFIAQ12857 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
NFIAQ12857 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
NFIAQ12857 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
NFIAQ12857 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
NFIAQ12857 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
NFIAQ12857 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
NFIAQ12857 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
NFIAQ12857 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
NFIAQ12857 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
NFIAQ12857 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
NFIAQ12857 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
NFIAQ12857 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
NFIAQ12857 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
NFIAQ12857 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
NFIAQ12857 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
NFIAQ12857 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
NFIAQ12857 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
NFIAQ12857 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
NFIAQ12857 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
NFIAQ12857 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
NFIAQ12857 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
NFIAQ12857 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
NFIAQ12857 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
NFIAQ12857 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
NFIAQ12857 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
NFIAQ12857 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
NFIAQ12857 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
NFIAQ12857 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
NFIAQ12857 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
NFIAQ12857 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
NFIAQ12857 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
NFIAQ12857 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
NFIAQ12857 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
NFIAQ12857 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
NFIAQ12857 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
NFIAQ12857 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NFIAQ12857 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NFIAQ12857 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NFIAQ12857 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
NFIAQ12857 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NFIAQ12857 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NFIAQ12857 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NFIAQ12857 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
NFIAQ12857 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NFIAQ12857 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
NFIAQ12857 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
NFIAQ12857 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
NFIAQ12857 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
NFIAQ12857 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NFIAQ12857 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NFIAQ12857 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
NFIAQ12857 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NFIAQ12857 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
NFIAQ12857 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
NFIAQ12857 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
NFIAQ12857 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
NFIAQ12857 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
NFIAQ12857 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC32.33■■■□□ 2.77
NFIAQ12857 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
NFIAQ12857 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
NFIAQ12857 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
NFIAQ12857 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
NFIAQ12857 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
NFIAQ12857 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
NFIAQ12857 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
NFIAQ12857 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
NFIAQ12857 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
NFIAQ12857 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
NFIAQ12857 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
NFIAQ12857 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
NFIAQ12857 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
NFIAQ12857 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
NFIAQ12857 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
NFIAQ12857 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
NFIAQ12857 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NFIAQ12857 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
NFIAQ12857 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
NFIAQ12857 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
NFIAQ12857 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
NFIAQ12857 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
NFIAQ12857 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NFIAQ12857 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
NFIAQ12857 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NFIAQ12857 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
NFIAQ12857 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC32.17■■■□□ 2.74
NFIAQ12857 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
NFIAQ12857 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NFIAQ12857 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NFIAQ12857 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
NFIAQ12857 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NFIAQ12857 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
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