Protein–RNA interactions for Protein: Q12748

CTF3, Inner kinetochore subunit CTF3, yeastyeast

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Length 733 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CTF3Q12748 YLR111WYLR111W 333 nt10.55□□□□□ -0.72
CTF3Q12748 PRO1YDR300C 1287 nt10.53□□□□□ -0.72
CTF3Q12748 SDH5YOL071W 489 nt10.53□□□□□ -0.72
CTF3Q12748 HIP1YGR191W 1812 nt10.53□□□□□ -0.72
CTF3Q12748 UTH1YKR042W 1098 nt10.52□□□□□ -0.73
CTF3Q12748 LSC2YGR244C 1284 nt10.51□□□□□ -0.73
CTF3Q12748 YML089CYML089C 369 nt10.5□□□□□ -0.73
CTF3Q12748 FUR4YBR021W 1902 nt10.5□□□□□ -0.73
CTF3Q12748 NRT1YOR071C 1797 nt10.47□□□□□ -0.73
CTF3Q12748 ATG15YCR068W 1563 nt10.47□□□□□ -0.73
CTF3Q12748 ARP6YLR085C 1317 nt10.44□□□□□ -0.74
CTF3Q12748 RAD23YEL037C 1197 nt10.44□□□□□ -0.74
CTF3Q12748 TIF6YPR016C 738 nt10.44□□□□□ -0.74
CTF3Q12748 MET28YIR017C 564 nt10.43□□□□□ -0.74
CTF3Q12748 SAM1YLR180W 1149 nt10.43□□□□□ -0.74
CTF3Q12748 TSC10YBR265W 963 nt10.43□□□□□ -0.74
CTF3Q12748 YGR012WYGR012W 1182 nt10.42□□□□□ -0.74
CTF3Q12748 CAB5YDR196C 726 nt10.4□□□□□ -0.74
CTF3Q12748 GAP1YKR039W 1809 nt10.4□□□□□ -0.75
CTF3Q12748 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt10.39□□□□□ -0.75
CTF3Q12748 PLB1YMR008C 1995 nt10.38□□□□□ -0.75
CTF3Q12748 RTN2YDL204W 1182 nt10.38□□□□□ -0.75
CTF3Q12748 YLR279WYLR279W 390 nt10.35□□□□□ -0.75
CTF3Q12748 RIB3YDR487C 627 nt10.34□□□□□ -0.75
CTF3Q12748 FIT3YOR383C 615 nt10.31□□□□□ -0.76
CTF3Q12748 YKR005CYKR005C 1578 nt10.31□□□□□ -0.76
CTF3Q12748 MSB4YOL112W 1479 nt10.3□□□□□ -0.76
CTF3Q12748 YGR259CYGR259C 441 nt10.3□□□□□ -0.76
CTF3Q12748 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt10.26□□□□□ -0.77
CTF3Q12748 HSP60YLR259C 1719 nt10.24□□□□□ -0.77
CTF3Q12748 UTR1YJR049C 1593 nt10.24□□□□□ -0.77
CTF3Q12748 DIF1YLR437C 402 nt10.24□□□□□ -0.77
CTF3Q12748 PRP4YPR178W 1398 nt10.23□□□□□ -0.77
CTF3Q12748 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.22□□□□□ -0.77
CTF3Q12748 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.22□□□□□ -0.77
CTF3Q12748 YAR028WYAR028W 705 nt10.2□□□□□ -0.78
CTF3Q12748 ALP1YNL270C 1722 nt10.19□□□□□ -0.78
CTF3Q12748 RAD51YER095W 1203 nt10.19□□□□□ -0.78
CTF3Q12748 ZTA1YBR046C 1005 nt10.19□□□□□ -0.78
CTF3Q12748 MTG2YHR168W 1557 nt10.18□□□□□ -0.78
CTF3Q12748 BOR1YNL275W 1731 nt10.17□□□□□ -0.78
CTF3Q12748 DPS1YLL018C 1674 nt10.17□□□□□ -0.78
CTF3Q12748 ADH1YOL086C 1047 nt10.15□□□□□ -0.78
CTF3Q12748 AKR2YOR034C 2250 nt10.15□□□□□ -0.78
CTF3Q12748 YJL195CYJL195C 702 nt10.14□□□□□ -0.79
CTF3Q12748 BMT6YLR063W 1098 nt10.14□□□□□ -0.79
CTF3Q12748 GND1YHR183W 1470 nt10.14□□□□□ -0.79
CTF3Q12748 FUN14YAL008W 597 nt10.13□□□□□ -0.79
CTF3Q12748 LOT5YKL183W 921 nt10.13□□□□□ -0.79
CTF3Q12748 STE4YOR212W 1272 nt10.13□□□□□ -0.79
CTF3Q12748 YPI1YFR003C 468 nt10.12□□□□□ -0.79
CTF3Q12748 PRM5YIL117C 957 nt10.11□□□□□ -0.79
CTF3Q12748 YLR349WYLR349W 507 nt10.1□□□□□ -0.79
CTF3Q12748 AAC1YMR056C 930 nt10.09□□□□□ -0.79
CTF3Q12748 SAM35YHR083W 990 nt10.08□□□□□ -0.8
CTF3Q12748 SMM1YNR015W 1155 nt10.08□□□□□ -0.8
CTF3Q12748 APT2YDR441C 546 nt10.07□□□□□ -0.8
CTF3Q12748 YNR029CYNR029C 1290 nt10.07□□□□□ -0.8
CTF3Q12748 UME6YDR207C 2511 nt10.07□□□□□ -0.8
CTF3Q12748 YER190C-AYER190C-A 576 nt10.06□□□□□ -0.8
CTF3Q12748 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt10.06□□□□□ -0.8
CTF3Q12748 IRC24YIR036C 792 nt10.06□□□□□ -0.8
CTF3Q12748 YML133W-AYML133W-A 576 nt10.06□□□□□ -0.8
CTF3Q12748 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt10.06□□□□□ -0.8
CTF3Q12748 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt10.06□□□□□ -0.8
CTF3Q12748 FCY21YER060W 1587 nt10.05□□□□□ -0.8
CTF3Q12748 SED1YDR077W 1017 nt10.03□□□□□ -0.8
CTF3Q12748 ADH7YCR105W 1086 nt10.01□□□□□ -0.81
CTF3Q12748 RPM1RPM1 483 nt10□□□□□ -0.81
CTF3Q12748 SNF1YDR477W 1902 nt9.99□□□□□ -0.81
CTF3Q12748 PAU15YIR041W 375 nt9.99□□□□□ -0.81
CTF3Q12748 LIP1YMR298W 453 nt9.99□□□□□ -0.81
CTF3Q12748 UGA4YDL210W 1716 nt9.99□□□□□ -0.81
CTF3Q12748 LSB3YFR024C-A 1380 nt9.98□□□□□ -0.81
CTF3Q12748 RIB2YOL066C 1776 nt9.97□□□□□ -0.81
CTF3Q12748 YEL008WYEL008W 381 nt9.97□□□□□ -0.81
CTF3Q12748 GPN2YOR262W 1044 nt9.96□□□□□ -0.82
CTF3Q12748 DBP1YPL119C 1854 nt9.96□□□□□ -0.82
CTF3Q12748 PRY1YJL079C 900 nt9.95□□□□□ -0.82
CTF3Q12748 ALD4YOR374W 1560 nt9.93□□□□□ -0.82
CTF3Q12748 YPL251WYPL251W 303 nt9.92□□□□□ -0.82
CTF3Q12748 HXT1YHR094C 1713 nt9.91□□□□□ -0.82
CTF3Q12748 YBL086CYBL086C 1401 nt9.9□□□□□ -0.82
CTF3Q12748 VRG4YGL225W 1014 nt9.9□□□□□ -0.82
CTF3Q12748 HXT12YIL170W 1374 nt9.89□□□□□ -0.83
CTF3Q12748 CPD1YGR247W 720 nt9.89□□□□□ -0.83
CTF3Q12748 HIF1YLL022C 1158 nt9.89□□□□□ -0.83
CTF3Q12748 BRR1YPR057W 1026 nt9.88□□□□□ -0.83
CTF3Q12748 LEU9YOR108W 1815 nt9.87□□□□□ -0.83
CTF3Q12748 MEP3YPR138C 1470 nt9.87□□□□□ -0.83
CTF3Q12748 YJL055WYJL055W 738 nt9.87□□□□□ -0.83
CTF3Q12748 YMR103CYMR103C 363 nt9.87□□□□□ -0.83
CTF3Q12748 TOA2YKL058W 369 nt9.86□□□□□ -0.83
CTF3Q12748 MCH5YOR306C 1566 nt9.84□□□□□ -0.83
CTF3Q12748 BIO5YNR056C 1686 nt9.82□□□□□ -0.84
CTF3Q12748 CSM1YCR086W 573 nt9.81□□□□□ -0.84
CTF3Q12748 ALG12YNR030W 1656 nt9.8□□□□□ -0.84
CTF3Q12748 GND2YGR256W 1479 nt9.79□□□□□ -0.84
CTF3Q12748 SHY1YGR112W 1170 nt9.78□□□□□ -0.84
CTF3Q12748 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt9.78□□□□□ -0.84
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