Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBP7

Shisal1, Protein shisa-like-1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal1Q0VBP7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Shisal1Q0VBP7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Shisal1Q0VBP7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Shisal1Q0VBP7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Shisal1Q0VBP7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Shisal1Q0VBP7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Shisal1Q0VBP7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Shisal1Q0VBP7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Shisal1Q0VBP7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Shisal1Q0VBP7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Shisal1Q0VBP7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Shisal1Q0VBP7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Shisal1Q0VBP7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Shisal1Q0VBP7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Shisal1Q0VBP7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Shisal1Q0VBP7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Shisal1Q0VBP7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Shisal1Q0VBP7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Shisal1Q0VBP7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Shisal1Q0VBP7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Shisal1Q0VBP7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Shisal1Q0VBP7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Shisal1Q0VBP7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Shisal1Q0VBP7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Shisal1Q0VBP7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Shisal1Q0VBP7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Shisal1Q0VBP7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Shisal1Q0VBP7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Shisal1Q0VBP7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Shisal1Q0VBP7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Shisal1Q0VBP7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Shisal1Q0VBP7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Shisal1Q0VBP7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Shisal1Q0VBP7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Shisal1Q0VBP7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Shisal1Q0VBP7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Shisal1Q0VBP7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Shisal1Q0VBP7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Shisal1Q0VBP7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Shisal1Q0VBP7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Shisal1Q0VBP7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Shisal1Q0VBP7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Shisal1Q0VBP7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Shisal1Q0VBP7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Shisal1Q0VBP7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Shisal1Q0VBP7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Shisal1Q0VBP7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Shisal1Q0VBP7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Shisal1Q0VBP7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Shisal1Q0VBP7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Shisal1Q0VBP7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Shisal1Q0VBP7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Shisal1Q0VBP7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Shisal1Q0VBP7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Shisal1Q0VBP7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Shisal1Q0VBP7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Shisal1Q0VBP7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Shisal1Q0VBP7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Shisal1Q0VBP7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Shisal1Q0VBP7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Shisal1Q0VBP7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Shisal1Q0VBP7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Shisal1Q0VBP7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Shisal1Q0VBP7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Shisal1Q0VBP7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Shisal1Q0VBP7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Shisal1Q0VBP7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Shisal1Q0VBP7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Shisal1Q0VBP7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Shisal1Q0VBP7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Shisal1Q0VBP7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Shisal1Q0VBP7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Shisal1Q0VBP7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Shisal1Q0VBP7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Shisal1Q0VBP7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Shisal1Q0VBP7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Shisal1Q0VBP7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Shisal1Q0VBP7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Shisal1Q0VBP7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shisal1Q0VBP7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shisal1Q0VBP7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shisal1Q0VBP7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shisal1Q0VBP7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shisal1Q0VBP7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shisal1Q0VBP7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shisal1Q0VBP7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Shisal1Q0VBP7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shisal1Q0VBP7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shisal1Q0VBP7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shisal1Q0VBP7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shisal1Q0VBP7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shisal1Q0VBP7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shisal1Q0VBP7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shisal1Q0VBP7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shisal1Q0VBP7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shisal1Q0VBP7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shisal1Q0VBP7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Shisal1Q0VBP7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Shisal1Q0VBP7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Shisal1Q0VBP7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms