Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5V9

Slc45a4, Solute carrier family 45 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc45a4Q0P5V9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slc45a4Q0P5V9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slc45a4Q0P5V9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slc45a4Q0P5V9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slc45a4Q0P5V9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc45a4Q0P5V9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slc45a4Q0P5V9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slc45a4Q0P5V9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slc45a4Q0P5V9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slc45a4Q0P5V9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slc45a4Q0P5V9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slc45a4Q0P5V9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slc45a4Q0P5V9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slc45a4Q0P5V9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc45a4Q0P5V9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slc45a4Q0P5V9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slc45a4Q0P5V9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc45a4Q0P5V9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc45a4Q0P5V9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc45a4Q0P5V9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc45a4Q0P5V9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc45a4Q0P5V9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slc45a4Q0P5V9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slc45a4Q0P5V9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slc45a4Q0P5V9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slc45a4Q0P5V9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Slc45a4Q0P5V9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Slc45a4Q0P5V9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc45a4Q0P5V9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc45a4Q0P5V9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc45a4Q0P5V9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc45a4Q0P5V9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc45a4Q0P5V9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc45a4Q0P5V9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc45a4Q0P5V9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc45a4Q0P5V9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc45a4Q0P5V9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc45a4Q0P5V9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Slc45a4Q0P5V9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc45a4Q0P5V9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc45a4Q0P5V9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc45a4Q0P5V9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc45a4Q0P5V9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc45a4Q0P5V9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc45a4Q0P5V9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc45a4Q0P5V9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc45a4Q0P5V9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc45a4Q0P5V9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc45a4Q0P5V9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc45a4Q0P5V9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc45a4Q0P5V9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc45a4Q0P5V9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc45a4Q0P5V9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc45a4Q0P5V9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc45a4Q0P5V9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc45a4Q0P5V9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc45a4Q0P5V9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc45a4Q0P5V9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc45a4Q0P5V9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc45a4Q0P5V9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc45a4Q0P5V9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc45a4Q0P5V9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc45a4Q0P5V9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc45a4Q0P5V9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc45a4Q0P5V9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc45a4Q0P5V9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc45a4Q0P5V9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc45a4Q0P5V9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc45a4Q0P5V9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc45a4Q0P5V9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Slc45a4Q0P5V9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slc45a4Q0P5V9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slc45a4Q0P5V9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slc45a4Q0P5V9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc45a4Q0P5V9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc45a4Q0P5V9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc45a4Q0P5V9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc45a4Q0P5V9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc45a4Q0P5V9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc45a4Q0P5V9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc45a4Q0P5V9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc45a4Q0P5V9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc45a4Q0P5V9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc45a4Q0P5V9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc45a4Q0P5V9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc45a4Q0P5V9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc45a4Q0P5V9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc45a4Q0P5V9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc45a4Q0P5V9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc45a4Q0P5V9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc45a4Q0P5V9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc45a4Q0P5V9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc45a4Q0P5V9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc45a4Q0P5V9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Slc45a4Q0P5V9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc45a4Q0P5V9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc45a4Q0P5V9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc45a4Q0P5V9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc45a4Q0P5V9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc45a4Q0P5V9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms