Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
1700061G19RikQ08EE8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
1700061G19RikQ08EE8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
1700061G19RikQ08EE8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
1700061G19RikQ08EE8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
1700061G19RikQ08EE8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
1700061G19RikQ08EE8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
1700061G19RikQ08EE8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
1700061G19RikQ08EE8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
1700061G19RikQ08EE8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
1700061G19RikQ08EE8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
1700061G19RikQ08EE8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
1700061G19RikQ08EE8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
1700061G19RikQ08EE8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
1700061G19RikQ08EE8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
1700061G19RikQ08EE8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
1700061G19RikQ08EE8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
1700061G19RikQ08EE8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
1700061G19RikQ08EE8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
1700061G19RikQ08EE8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
1700061G19RikQ08EE8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
1700061G19RikQ08EE8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
1700061G19RikQ08EE8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
1700061G19RikQ08EE8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
1700061G19RikQ08EE8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
1700061G19RikQ08EE8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
1700061G19RikQ08EE8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
1700061G19RikQ08EE8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
1700061G19RikQ08EE8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
1700061G19RikQ08EE8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
1700061G19RikQ08EE8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
1700061G19RikQ08EE8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
1700061G19RikQ08EE8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
1700061G19RikQ08EE8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
1700061G19RikQ08EE8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
1700061G19RikQ08EE8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
1700061G19RikQ08EE8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
1700061G19RikQ08EE8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
1700061G19RikQ08EE8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
1700061G19RikQ08EE8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
1700061G19RikQ08EE8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
1700061G19RikQ08EE8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
1700061G19RikQ08EE8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
1700061G19RikQ08EE8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
1700061G19RikQ08EE8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
1700061G19RikQ08EE8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
1700061G19RikQ08EE8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
1700061G19RikQ08EE8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
1700061G19RikQ08EE8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
1700061G19RikQ08EE8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
1700061G19RikQ08EE8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
1700061G19RikQ08EE8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
1700061G19RikQ08EE8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
1700061G19RikQ08EE8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
1700061G19RikQ08EE8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
1700061G19RikQ08EE8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
1700061G19RikQ08EE8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
1700061G19RikQ08EE8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
1700061G19RikQ08EE8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
1700061G19RikQ08EE8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
1700061G19RikQ08EE8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
1700061G19RikQ08EE8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
1700061G19RikQ08EE8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
1700061G19RikQ08EE8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
1700061G19RikQ08EE8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
1700061G19RikQ08EE8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
1700061G19RikQ08EE8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
1700061G19RikQ08EE8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
1700061G19RikQ08EE8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
1700061G19RikQ08EE8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
1700061G19RikQ08EE8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
1700061G19RikQ08EE8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
1700061G19RikQ08EE8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
1700061G19RikQ08EE8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
1700061G19RikQ08EE8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
1700061G19RikQ08EE8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
1700061G19RikQ08EE8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
1700061G19RikQ08EE8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
1700061G19RikQ08EE8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
1700061G19RikQ08EE8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
1700061G19RikQ08EE8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
1700061G19RikQ08EE8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
1700061G19RikQ08EE8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
1700061G19RikQ08EE8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
1700061G19RikQ08EE8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
1700061G19RikQ08EE8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
1700061G19RikQ08EE8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
1700061G19RikQ08EE8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
1700061G19RikQ08EE8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
1700061G19RikQ08EE8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
1700061G19RikQ08EE8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
1700061G19RikQ08EE8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
1700061G19RikQ08EE8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
1700061G19RikQ08EE8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
1700061G19RikQ08EE8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
1700061G19RikQ08EE8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
1700061G19RikQ08EE8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
1700061G19RikQ08EE8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
1700061G19RikQ08EE8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
1700061G19RikQ08EE8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 185.1 ms