Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
C2orf54Q08AI8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
C2orf54Q08AI8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
C2orf54Q08AI8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.16
C2orf54Q08AI8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
C2orf54Q08AI8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
C2orf54Q08AI8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
C2orf54Q08AI8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
C2orf54Q08AI8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
C2orf54Q08AI8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
C2orf54Q08AI8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
C2orf54Q08AI8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
C2orf54Q08AI8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
C2orf54Q08AI8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
C2orf54Q08AI8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
C2orf54Q08AI8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
C2orf54Q08AI8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
C2orf54Q08AI8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
C2orf54Q08AI8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
C2orf54Q08AI8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
C2orf54Q08AI8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
C2orf54Q08AI8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
C2orf54Q08AI8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
C2orf54Q08AI8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
C2orf54Q08AI8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
C2orf54Q08AI8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
C2orf54Q08AI8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
C2orf54Q08AI8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
C2orf54Q08AI8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
C2orf54Q08AI8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
C2orf54Q08AI8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
C2orf54Q08AI8 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
C2orf54Q08AI8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
C2orf54Q08AI8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
C2orf54Q08AI8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
C2orf54Q08AI8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
C2orf54Q08AI8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
C2orf54Q08AI8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
C2orf54Q08AI8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
C2orf54Q08AI8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
C2orf54Q08AI8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
C2orf54Q08AI8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
C2orf54Q08AI8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
C2orf54Q08AI8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
C2orf54Q08AI8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
C2orf54Q08AI8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
C2orf54Q08AI8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
C2orf54Q08AI8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
C2orf54Q08AI8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
C2orf54Q08AI8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
C2orf54Q08AI8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
C2orf54Q08AI8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
C2orf54Q08AI8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
C2orf54Q08AI8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
C2orf54Q08AI8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
C2orf54Q08AI8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
C2orf54Q08AI8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
C2orf54Q08AI8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
C2orf54Q08AI8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
C2orf54Q08AI8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
C2orf54Q08AI8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
C2orf54Q08AI8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
C2orf54Q08AI8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
C2orf54Q08AI8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
C2orf54Q08AI8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
C2orf54Q08AI8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
C2orf54Q08AI8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
C2orf54Q08AI8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
C2orf54Q08AI8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
C2orf54Q08AI8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
C2orf54Q08AI8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
C2orf54Q08AI8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
C2orf54Q08AI8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
C2orf54Q08AI8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
C2orf54Q08AI8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
C2orf54Q08AI8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
C2orf54Q08AI8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
C2orf54Q08AI8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
C2orf54Q08AI8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
C2orf54Q08AI8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
C2orf54Q08AI8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
C2orf54Q08AI8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
C2orf54Q08AI8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
C2orf54Q08AI8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
C2orf54Q08AI8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
C2orf54Q08AI8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
C2orf54Q08AI8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
C2orf54Q08AI8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
C2orf54Q08AI8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
C2orf54Q08AI8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
C2orf54Q08AI8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
C2orf54Q08AI8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
C2orf54Q08AI8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
C2orf54Q08AI8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
C2orf54Q08AI8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
C2orf54Q08AI8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
C2orf54Q08AI8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
C2orf54Q08AI8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
C2orf54Q08AI8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
C2orf54Q08AI8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.3 ms