Protein–RNA interactions for Protein: Q08999

RBL2, Retinoblastoma-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL2Q08999 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
RBL2Q08999 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
RBL2Q08999 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
RBL2Q08999 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
RBL2Q08999 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
RBL2Q08999 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
RBL2Q08999 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
RBL2Q08999 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
RBL2Q08999 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
RBL2Q08999 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
RBL2Q08999 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
RBL2Q08999 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
RBL2Q08999 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
RBL2Q08999 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
RBL2Q08999 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
RBL2Q08999 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
RBL2Q08999 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
RBL2Q08999 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
RBL2Q08999 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
RBL2Q08999 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
RBL2Q08999 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
RBL2Q08999 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
RBL2Q08999 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
RBL2Q08999 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
RBL2Q08999 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
RBL2Q08999 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
RBL2Q08999 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
RBL2Q08999 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
RBL2Q08999 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
RBL2Q08999 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
RBL2Q08999 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
RBL2Q08999 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
RBL2Q08999 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
RBL2Q08999 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
RBL2Q08999 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
RBL2Q08999 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
RBL2Q08999 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
RBL2Q08999 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
RBL2Q08999 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
RBL2Q08999 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
RBL2Q08999 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
RBL2Q08999 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
RBL2Q08999 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.62■■■□□ 2.49
RBL2Q08999 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
RBL2Q08999 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
RBL2Q08999 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
RBL2Q08999 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.6■■■□□ 2.49
RBL2Q08999 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
RBL2Q08999 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
RBL2Q08999 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
RBL2Q08999 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
RBL2Q08999 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
RBL2Q08999 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
RBL2Q08999 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
RBL2Q08999 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
RBL2Q08999 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
RBL2Q08999 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
RBL2Q08999 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
RBL2Q08999 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
RBL2Q08999 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
RBL2Q08999 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
RBL2Q08999 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
RBL2Q08999 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
RBL2Q08999 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
RBL2Q08999 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
RBL2Q08999 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
RBL2Q08999 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
RBL2Q08999 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
RBL2Q08999 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
RBL2Q08999 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
RBL2Q08999 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
RBL2Q08999 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
RBL2Q08999 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
RBL2Q08999 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
RBL2Q08999 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
RBL2Q08999 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
RBL2Q08999 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
RBL2Q08999 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
RBL2Q08999 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
RBL2Q08999 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
RBL2Q08999 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RBL2Q08999 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RBL2Q08999 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
RBL2Q08999 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
RBL2Q08999 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
RBL2Q08999 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
RBL2Q08999 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RBL2Q08999 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RBL2Q08999 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RBL2Q08999 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
RBL2Q08999 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
RBL2Q08999 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
RBL2Q08999 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
RBL2Q08999 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
RBL2Q08999 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
RBL2Q08999 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
RBL2Q08999 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
RBL2Q08999 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RBL2Q08999 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
RBL2Q08999 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms