Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CD300CQ08708 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CD300CQ08708 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CD300CQ08708 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CD300CQ08708 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CD300CQ08708 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CD300CQ08708 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CD300CQ08708 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CD300CQ08708 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CD300CQ08708 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CD300CQ08708 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CD300CQ08708 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CD300CQ08708 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CD300CQ08708 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD300CQ08708 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD300CQ08708 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CD300CQ08708 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD300CQ08708 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD300CQ08708 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD300CQ08708 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD300CQ08708 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD300CQ08708 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD300CQ08708 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD300CQ08708 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD300CQ08708 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CD300CQ08708 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD300CQ08708 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CD300CQ08708 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD300CQ08708 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD300CQ08708 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD300CQ08708 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD300CQ08708 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD300CQ08708 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CD300CQ08708 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CD300CQ08708 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CD300CQ08708 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CD300CQ08708 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CD300CQ08708 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CD300CQ08708 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD300CQ08708 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD300CQ08708 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD300CQ08708 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CD300CQ08708 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD300CQ08708 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD300CQ08708 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD300CQ08708 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD300CQ08708 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD300CQ08708 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD300CQ08708 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD300CQ08708 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD300CQ08708 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD300CQ08708 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CD300CQ08708 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD300CQ08708 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD300CQ08708 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD300CQ08708 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD300CQ08708 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD300CQ08708 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD300CQ08708 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD300CQ08708 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD300CQ08708 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD300CQ08708 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD300CQ08708 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD300CQ08708 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD300CQ08708 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD300CQ08708 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD300CQ08708 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD300CQ08708 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD300CQ08708 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD300CQ08708 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD300CQ08708 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD300CQ08708 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD300CQ08708 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD300CQ08708 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD300CQ08708 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD300CQ08708 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CD300CQ08708 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD300CQ08708 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CD300CQ08708 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD300CQ08708 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD300CQ08708 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD300CQ08708 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD300CQ08708 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD300CQ08708 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD300CQ08708 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD300CQ08708 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD300CQ08708 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD300CQ08708 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CD300CQ08708 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD300CQ08708 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD300CQ08708 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD300CQ08708 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD300CQ08708 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD300CQ08708 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD300CQ08708 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD300CQ08708 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD300CQ08708 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD300CQ08708 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD300CQ08708 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD300CQ08708 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms