Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CYP4F3Q08477 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CYP4F3Q08477 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CYP4F3Q08477 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CYP4F3Q08477 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CYP4F3Q08477 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CYP4F3Q08477 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CYP4F3Q08477 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CYP4F3Q08477 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CYP4F3Q08477 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CYP4F3Q08477 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CYP4F3Q08477 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CYP4F3Q08477 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CYP4F3Q08477 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CYP4F3Q08477 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CYP4F3Q08477 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CYP4F3Q08477 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CYP4F3Q08477 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CYP4F3Q08477 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CYP4F3Q08477 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CYP4F3Q08477 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CYP4F3Q08477 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CYP4F3Q08477 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CYP4F3Q08477 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CYP4F3Q08477 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CYP4F3Q08477 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CYP4F3Q08477 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CYP4F3Q08477 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CYP4F3Q08477 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CYP4F3Q08477 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CYP4F3Q08477 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CYP4F3Q08477 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CYP4F3Q08477 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CYP4F3Q08477 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CYP4F3Q08477 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CYP4F3Q08477 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CYP4F3Q08477 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CYP4F3Q08477 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CYP4F3Q08477 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CYP4F3Q08477 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CYP4F3Q08477 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CYP4F3Q08477 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CYP4F3Q08477 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CYP4F3Q08477 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CYP4F3Q08477 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CYP4F3Q08477 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CYP4F3Q08477 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CYP4F3Q08477 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CYP4F3Q08477 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CYP4F3Q08477 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CYP4F3Q08477 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CYP4F3Q08477 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CYP4F3Q08477 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CYP4F3Q08477 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CYP4F3Q08477 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CYP4F3Q08477 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CYP4F3Q08477 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CYP4F3Q08477 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CYP4F3Q08477 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CYP4F3Q08477 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CYP4F3Q08477 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CYP4F3Q08477 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CYP4F3Q08477 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CYP4F3Q08477 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CYP4F3Q08477 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CYP4F3Q08477 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CYP4F3Q08477 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CYP4F3Q08477 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CYP4F3Q08477 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CYP4F3Q08477 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CYP4F3Q08477 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CYP4F3Q08477 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CYP4F3Q08477 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CYP4F3Q08477 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CYP4F3Q08477 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CYP4F3Q08477 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CYP4F3Q08477 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CYP4F3Q08477 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CYP4F3Q08477 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CYP4F3Q08477 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CYP4F3Q08477 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CYP4F3Q08477 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CYP4F3Q08477 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CYP4F3Q08477 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CYP4F3Q08477 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CYP4F3Q08477 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CYP4F3Q08477 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CYP4F3Q08477 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CYP4F3Q08477 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CYP4F3Q08477 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CYP4F3Q08477 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CYP4F3Q08477 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CYP4F3Q08477 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CYP4F3Q08477 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CYP4F3Q08477 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CYP4F3Q08477 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CYP4F3Q08477 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CYP4F3Q08477 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CYP4F3Q08477 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CYP4F3Q08477 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms