Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Cdx4Q07424 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cdx4Q07424 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cdx4Q07424 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cdx4Q07424 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cdx4Q07424 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cdx4Q07424 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cdx4Q07424 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdx4Q07424 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdx4Q07424 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdx4Q07424 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdx4Q07424 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cdx4Q07424 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdx4Q07424 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdx4Q07424 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdx4Q07424 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdx4Q07424 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdx4Q07424 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdx4Q07424 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdx4Q07424 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdx4Q07424 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdx4Q07424 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cdx4Q07424 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdx4Q07424 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdx4Q07424 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdx4Q07424 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdx4Q07424 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdx4Q07424 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdx4Q07424 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdx4Q07424 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdx4Q07424 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdx4Q07424 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdx4Q07424 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdx4Q07424 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdx4Q07424 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cdx4Q07424 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cdx4Q07424 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cdx4Q07424 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdx4Q07424 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdx4Q07424 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdx4Q07424 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdx4Q07424 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdx4Q07424 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cdx4Q07424 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdx4Q07424 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdx4Q07424 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdx4Q07424 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdx4Q07424 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdx4Q07424 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cdx4Q07424 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cdx4Q07424 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdx4Q07424 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cdx4Q07424 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cdx4Q07424 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cdx4Q07424 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cdx4Q07424 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Cdx4Q07424 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cdx4Q07424 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdx4Q07424 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdx4Q07424 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdx4Q07424 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdx4Q07424 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdx4Q07424 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdx4Q07424 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdx4Q07424 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdx4Q07424 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdx4Q07424 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdx4Q07424 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdx4Q07424 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdx4Q07424 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdx4Q07424 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdx4Q07424 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdx4Q07424 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdx4Q07424 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdx4Q07424 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdx4Q07424 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdx4Q07424 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdx4Q07424 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdx4Q07424 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdx4Q07424 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdx4Q07424 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdx4Q07424 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdx4Q07424 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdx4Q07424 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdx4Q07424 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdx4Q07424 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdx4Q07424 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdx4Q07424 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdx4Q07424 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cdx4Q07424 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cdx4Q07424 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cdx4Q07424 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cdx4Q07424 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cdx4Q07424 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cdx4Q07424 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cdx4Q07424 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdx4Q07424 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdx4Q07424 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdx4Q07424 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdx4Q07424 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms