Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cntn3Q07409 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cntn3Q07409 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cntn3Q07409 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Cntn3Q07409 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Cntn3Q07409 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cntn3Q07409 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Cntn3Q07409 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cntn3Q07409 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cntn3Q07409 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cntn3Q07409 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cntn3Q07409 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Cntn3Q07409 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cntn3Q07409 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cntn3Q07409 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cntn3Q07409 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cntn3Q07409 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cntn3Q07409 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cntn3Q07409 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cntn3Q07409 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Cntn3Q07409 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cntn3Q07409 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cntn3Q07409 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cntn3Q07409 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cntn3Q07409 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cntn3Q07409 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cntn3Q07409 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cntn3Q07409 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cntn3Q07409 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cntn3Q07409 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cntn3Q07409 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cntn3Q07409 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cntn3Q07409 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cntn3Q07409 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cntn3Q07409 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cntn3Q07409 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cntn3Q07409 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cntn3Q07409 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Cntn3Q07409 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Cntn3Q07409 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Cntn3Q07409 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cntn3Q07409 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cntn3Q07409 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cntn3Q07409 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cntn3Q07409 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Cntn3Q07409 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cntn3Q07409 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cntn3Q07409 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cntn3Q07409 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cntn3Q07409 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cntn3Q07409 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cntn3Q07409 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cntn3Q07409 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cntn3Q07409 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cntn3Q07409 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cntn3Q07409 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cntn3Q07409 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Cntn3Q07409 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cntn3Q07409 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cntn3Q07409 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cntn3Q07409 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cntn3Q07409 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cntn3Q07409 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cntn3Q07409 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cntn3Q07409 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cntn3Q07409 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cntn3Q07409 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cntn3Q07409 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cntn3Q07409 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cntn3Q07409 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cntn3Q07409 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cntn3Q07409 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cntn3Q07409 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cntn3Q07409 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cntn3Q07409 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Cntn3Q07409 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cntn3Q07409 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Cntn3Q07409 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cntn3Q07409 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cntn3Q07409 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cntn3Q07409 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cntn3Q07409 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cntn3Q07409 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cntn3Q07409 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cntn3Q07409 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cntn3Q07409 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cntn3Q07409 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Cntn3Q07409 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cntn3Q07409 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cntn3Q07409 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cntn3Q07409 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cntn3Q07409 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cntn3Q07409 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cntn3Q07409 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cntn3Q07409 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cntn3Q07409 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cntn3Q07409 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cntn3Q07409 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cntn3Q07409 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cntn3Q07409 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms