Protein–RNA interactions for Protein: Q07084

SSK1, Osmolarity two-component system protein SSK1, yeastyeast

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Length 712 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSK1Q07084 VPS75YNL246W 795 nt8.92□□□□□ -0.98
SSK1Q07084 SHH4YLR164W 507 nt8.88□□□□□ -0.99
SSK1Q07084 RPC82YPR190C 1965 nt8.88□□□□□ -0.99
SSK1Q07084 UTR1YJR049C 1593 nt8.87□□□□□ -0.99
SSK1Q07084 LSC2YGR244C 1284 nt8.87□□□□□ -0.99
SSK1Q07084 TIR3YIL011W 810 nt8.87□□□□□ -0.99
SSK1Q07084 MIR1YJR077C 936 nt8.83□□□□□ -1
SSK1Q07084 GAP1YKR039W 1809 nt8.82□□□□□ -1
SSK1Q07084 SAM35YHR083W 990 nt8.82□□□□□ -1
SSK1Q07084 POM34YLR018C 900 nt8.81□□□□□ -1
SSK1Q07084 YDR010CYDR010C 333 nt8.79□□□□□ -1
SSK1Q07084 PRO1YDR300C 1287 nt8.79□□□□□ -1
SSK1Q07084 ZRT3YKL175W 1512 nt8.77□□□□□ -1.01
SSK1Q07084 SFA1YDL168W 1161 nt8.76□□□□□ -1.01
SSK1Q07084 SBA1YKL117W 651 nt8.75□□□□□ -1.01
SSK1Q07084 NAT4YMR069W 858 nt8.75□□□□□ -1.01
SSK1Q07084 MSF1YPR047W 1410 nt8.73□□□□□ -1.01
SSK1Q07084 THI74YDR438W 1113 nt8.73□□□□□ -1.01
SSK1Q07084 DIF1YLR437C 402 nt8.72□□□□□ -1.01
SSK1Q07084 DBP1YPL119C 1854 nt8.72□□□□□ -1.01
SSK1Q07084 RIM8YGL045W 1629 nt8.71□□□□□ -1.02
SSK1Q07084 SSN3YPL042C 1668 nt8.7□□□□□ -1.02
SSK1Q07084 SHB17YKR043C 816 nt8.7□□□□□ -1.02
SSK1Q07084 YML089CYML089C 369 nt8.7□□□□□ -1.02
SSK1Q07084 ATG15YCR068W 1563 nt8.68□□□□□ -1.02
SSK1Q07084 RET2YFR051C 1641 nt8.67□□□□□ -1.02
SSK1Q07084 MUP1YGR055W 1725 nt8.66□□□□□ -1.02
SSK1Q07084 UBA4YHR111W 1323 nt8.66□□□□□ -1.02
SSK1Q07084 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt8.66□□□□□ -1.02
SSK1Q07084 YJL067WYJL067W 351 nt8.66□□□□□ -1.02
SSK1Q07084 TOM6YOR045W 186 nt8.66□□□□□ -1.02
SSK1Q07084 MET2YNL277W 1461 nt8.65□□□□□ -1.02
SSK1Q07084 PAU7YAR020C 168 nt8.65□□□□□ -1.02
SSK1Q07084 TIF6YPR016C 738 nt8.64□□□□□ -1.03
SSK1Q07084 HXT1YHR094C 1713 nt8.63□□□□□ -1.03
SSK1Q07084 GID7YCL039W 2238 nt8.63□□□□□ -1.03
SSK1Q07084 SFP1YLR403W 2052 nt8.63□□□□□ -1.03
SSK1Q07084 MAE1YKL029C 2010 nt8.63□□□□□ -1.03
SSK1Q07084 YGL114WYGL114W 2178 nt8.61□□□□□ -1.03
SSK1Q07084 YNL024CYNL024C 741 nt8.6□□□□□ -1.03
SSK1Q07084 HIP1YGR191W 1812 nt8.59□□□□□ -1.03
SSK1Q07084 YGL034CYGL034C 366 nt8.59□□□□□ -1.03
SSK1Q07084 SHY1YGR112W 1170 nt8.59□□□□□ -1.03
SSK1Q07084 HOL1YNR055C 1761 nt8.58□□□□□ -1.04
SSK1Q07084 FRE6YLL051C 2139 nt8.57□□□□□ -1.04
SSK1Q07084 YSR3YKR053C 1215 nt8.57□□□□□ -1.04
SSK1Q07084 NPP1YCR026C 2229 nt8.56□□□□□ -1.04
SSK1Q07084 PEX2YJL210W 816 nt8.56□□□□□ -1.04
SSK1Q07084 COQ2YNR041C 1119 nt8.56□□□□□ -1.04
SSK1Q07084 YBL086CYBL086C 1401 nt8.55□□□□□ -1.04
SSK1Q07084 PHO89YBR296C 1725 nt8.55□□□□□ -1.04
SSK1Q07084 XYL2YLR070C 1071 nt8.54□□□□□ -1.04
SSK1Q07084 ILV3YJR016C 1758 nt8.53□□□□□ -1.04
SSK1Q07084 MTG2YHR168W 1557 nt8.53□□□□□ -1.04
SSK1Q07084 YAR028WYAR028W 705 nt8.53□□□□□ -1.04
SSK1Q07084 YER190C-AYER190C-A 576 nt8.52□□□□□ -1.05
SSK1Q07084 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt8.52□□□□□ -1.05
SSK1Q07084 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt8.52□□□□□ -1.05
SSK1Q07084 YML133W-AYML133W-A 576 nt8.52□□□□□ -1.05
SSK1Q07084 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt8.52□□□□□ -1.05
SSK1Q07084 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt8.52□□□□□ -1.05
SSK1Q07084 UFO1YML088W 2007 nt8.52□□□□□ -1.05
SSK1Q07084 CWC15YDR163W 528 nt8.51□□□□□ -1.05
SSK1Q07084 YOR325WYOR325W 474 nt8.51□□□□□ -1.05
SSK1Q07084 LEU9YOR108W 1815 nt8.5□□□□□ -1.05
SSK1Q07084 MET28YIR017C 564 nt8.5□□□□□ -1.05
SSK1Q07084 LIP1YMR298W 453 nt8.5□□□□□ -1.05
SSK1Q07084 SED1YDR077W 1017 nt8.48□□□□□ -1.05
SSK1Q07084 URA6YKL024C 615 nt8.48□□□□□ -1.05
SSK1Q07084 YCR087WYCR087W 516 nt8.46□□□□□ -1.06
SSK1Q07084 MRP20YDR405W 792 nt8.46□□□□□ -1.06
SSK1Q07084 YMR244WYMR244W 1068 nt8.46□□□□□ -1.06
SSK1Q07084 AIM45YPR004C 1035 nt8.46□□□□□ -1.06
SSK1Q07084 HMG2YLR450W 3138 nt8.46□□□□□ -1.06
SSK1Q07084 HIS2YFR025C 1008 nt8.45□□□□□ -1.06
SSK1Q07084 ZTA1YBR046C 1005 nt8.45□□□□□ -1.06
SSK1Q07084 YPL251WYPL251W 303 nt8.45□□□□□ -1.06
SSK1Q07084 ACO2YJL200C 2370 nt8.44□□□□□ -1.06
SSK1Q07084 ESBP6YNL125C 2022 nt8.44□□□□□ -1.06
SSK1Q07084 RBG1YAL036C 1110 nt8.44□□□□□ -1.06
SSK1Q07084 SAM1YLR180W 1149 nt8.44□□□□□ -1.06
SSK1Q07084 TPO4YOR273C 1980 nt8.44□□□□□ -1.06
SSK1Q07084 YMR209CYMR209C 1374 nt8.43□□□□□ -1.06
SSK1Q07084 COQ8YGL119W 1506 nt8.43□□□□□ -1.06
SSK1Q07084 OPI10YOL032W 741 nt8.42□□□□□ -1.06
SSK1Q07084 NRT1YOR071C 1797 nt8.42□□□□□ -1.06
SSK1Q07084 CCT2YIL142W 1584 nt8.41□□□□□ -1.06
SSK1Q07084 GLR1YPL091W 1452 nt8.41□□□□□ -1.06
SSK1Q07084 BET2YPR176C 978 nt8.41□□□□□ -1.06
SSK1Q07084 RFC1YOR217W 2586 nt8.41□□□□□ -1.06
SSK1Q07084 UGA4YDL210W 1716 nt8.4□□□□□ -1.06
SSK1Q07084 ALP1YNL270C 1722 nt8.4□□□□□ -1.06
SSK1Q07084 RPL4BYDR012W 1089 nt8.4□□□□□ -1.06
SSK1Q07084 RPS14BYJL191W 417 nt8.4□□□□□ -1.06
SSK1Q07084 TOA2YKL058W 369 nt8.4□□□□□ -1.06
SSK1Q07084 UTH1YKR042W 1098 nt8.4□□□□□ -1.06
SSK1Q07084 RPL4AYBR031W 1089 nt8.4□□□□□ -1.06
SSK1Q07084 BRR1YPR057W 1026 nt8.39□□□□□ -1.07
SSK1Q07084 AKR2YOR034C 2250 nt8.39□□□□□ -1.07
SSK1Q07084 ARO8YGL202W 1503 nt8.39□□□□□ -1.07
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