Protein–RNA interactions for Protein: Q06455

RUNX1T1, Protein CBFA2T1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1T1Q06455 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RUNX1T1Q06455 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RUNX1T1Q06455 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RUNX1T1Q06455 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RUNX1T1Q06455 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RUNX1T1Q06455 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RUNX1T1Q06455 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RUNX1T1Q06455 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RUNX1T1Q06455 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RUNX1T1Q06455 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RUNX1T1Q06455 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RUNX1T1Q06455 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RUNX1T1Q06455 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RUNX1T1Q06455 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RUNX1T1Q06455 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RUNX1T1Q06455 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RUNX1T1Q06455 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RUNX1T1Q06455 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RUNX1T1Q06455 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RUNX1T1Q06455 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RUNX1T1Q06455 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RUNX1T1Q06455 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RUNX1T1Q06455 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RUNX1T1Q06455 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RUNX1T1Q06455 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RUNX1T1Q06455 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RUNX1T1Q06455 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RUNX1T1Q06455 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RUNX1T1Q06455 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RUNX1T1Q06455 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RUNX1T1Q06455 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RUNX1T1Q06455 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RUNX1T1Q06455 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RUNX1T1Q06455 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RUNX1T1Q06455 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RUNX1T1Q06455 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RUNX1T1Q06455 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RUNX1T1Q06455 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RUNX1T1Q06455 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RUNX1T1Q06455 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RUNX1T1Q06455 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RUNX1T1Q06455 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RUNX1T1Q06455 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RUNX1T1Q06455 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RUNX1T1Q06455 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RUNX1T1Q06455 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RUNX1T1Q06455 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RUNX1T1Q06455 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RUNX1T1Q06455 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RUNX1T1Q06455 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RUNX1T1Q06455 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RUNX1T1Q06455 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RUNX1T1Q06455 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RUNX1T1Q06455 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RUNX1T1Q06455 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RUNX1T1Q06455 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RUNX1T1Q06455 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RUNX1T1Q06455 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RUNX1T1Q06455 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RUNX1T1Q06455 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RUNX1T1Q06455 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RUNX1T1Q06455 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RUNX1T1Q06455 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RUNX1T1Q06455 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RUNX1T1Q06455 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RUNX1T1Q06455 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RUNX1T1Q06455 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RUNX1T1Q06455 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RUNX1T1Q06455 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RUNX1T1Q06455 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RUNX1T1Q06455 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RUNX1T1Q06455 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RUNX1T1Q06455 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RUNX1T1Q06455 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RUNX1T1Q06455 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RUNX1T1Q06455 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RUNX1T1Q06455 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RUNX1T1Q06455 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RUNX1T1Q06455 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RUNX1T1Q06455 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUNX1T1Q06455 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUNX1T1Q06455 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUNX1T1Q06455 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RUNX1T1Q06455 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RUNX1T1Q06455 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RUNX1T1Q06455 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RUNX1T1Q06455 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RUNX1T1Q06455 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RUNX1T1Q06455 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUNX1T1Q06455 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUNX1T1Q06455 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUNX1T1Q06455 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RUNX1T1Q06455 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RUNX1T1Q06455 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RUNX1T1Q06455 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RUNX1T1Q06455 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RUNX1T1Q06455 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RUNX1T1Q06455 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RUNX1T1Q06455 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUNX1T1Q06455 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms