Protein–RNA interactions for Protein: Q05C16

LRRC63, Leucine-rich repeat-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC63Q05C16 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
LRRC63Q05C16 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
LRRC63Q05C16 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
LRRC63Q05C16 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
LRRC63Q05C16 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
LRRC63Q05C16 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LRRC63Q05C16 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LRRC63Q05C16 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LRRC63Q05C16 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
LRRC63Q05C16 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
LRRC63Q05C16 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
LRRC63Q05C16 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
LRRC63Q05C16 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
LRRC63Q05C16 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LRRC63Q05C16 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
LRRC63Q05C16 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
LRRC63Q05C16 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
LRRC63Q05C16 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
LRRC63Q05C16 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
LRRC63Q05C16 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
LRRC63Q05C16 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
LRRC63Q05C16 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
LRRC63Q05C16 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
LRRC63Q05C16 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
LRRC63Q05C16 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
LRRC63Q05C16 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
LRRC63Q05C16 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
LRRC63Q05C16 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
LRRC63Q05C16 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LRRC63Q05C16 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LRRC63Q05C16 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
LRRC63Q05C16 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
LRRC63Q05C16 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LRRC63Q05C16 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
LRRC63Q05C16 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LRRC63Q05C16 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LRRC63Q05C16 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
LRRC63Q05C16 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LRRC63Q05C16 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
LRRC63Q05C16 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
LRRC63Q05C16 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
LRRC63Q05C16 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
LRRC63Q05C16 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LRRC63Q05C16 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LRRC63Q05C16 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LRRC63Q05C16 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LRRC63Q05C16 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LRRC63Q05C16 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
LRRC63Q05C16 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LRRC63Q05C16 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LRRC63Q05C16 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LRRC63Q05C16 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
LRRC63Q05C16 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LRRC63Q05C16 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LRRC63Q05C16 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
LRRC63Q05C16 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LRRC63Q05C16 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LRRC63Q05C16 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LRRC63Q05C16 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LRRC63Q05C16 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LRRC63Q05C16 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LRRC63Q05C16 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LRRC63Q05C16 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LRRC63Q05C16 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LRRC63Q05C16 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LRRC63Q05C16 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LRRC63Q05C16 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LRRC63Q05C16 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LRRC63Q05C16 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
LRRC63Q05C16 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LRRC63Q05C16 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
LRRC63Q05C16 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
LRRC63Q05C16 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
LRRC63Q05C16 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LRRC63Q05C16 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LRRC63Q05C16 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LRRC63Q05C16 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
LRRC63Q05C16 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LRRC63Q05C16 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
LRRC63Q05C16 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LRRC63Q05C16 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LRRC63Q05C16 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LRRC63Q05C16 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LRRC63Q05C16 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LRRC63Q05C16 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LRRC63Q05C16 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LRRC63Q05C16 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
LRRC63Q05C16 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
LRRC63Q05C16 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LRRC63Q05C16 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LRRC63Q05C16 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LRRC63Q05C16 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LRRC63Q05C16 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LRRC63Q05C16 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LRRC63Q05C16 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LRRC63Q05C16 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LRRC63Q05C16 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
LRRC63Q05C16 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
LRRC63Q05C16 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LRRC63Q05C16 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.4 ms