Protein–RNA interactions for Protein: Q04759

PRKCQ, Protein kinase C theta type, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCQQ04759 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRKCQQ04759 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRKCQQ04759 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRKCQQ04759 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PRKCQQ04759 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRKCQQ04759 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRKCQQ04759 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRKCQQ04759 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRKCQQ04759 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRKCQQ04759 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRKCQQ04759 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRKCQQ04759 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRKCQQ04759 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRKCQQ04759 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRKCQQ04759 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRKCQQ04759 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRKCQQ04759 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRKCQQ04759 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRKCQQ04759 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRKCQQ04759 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRKCQQ04759 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRKCQQ04759 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRKCQQ04759 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRKCQQ04759 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRKCQQ04759 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PRKCQQ04759 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRKCQQ04759 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRKCQQ04759 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRKCQQ04759 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRKCQQ04759 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRKCQQ04759 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRKCQQ04759 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRKCQQ04759 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRKCQQ04759 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRKCQQ04759 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRKCQQ04759 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRKCQQ04759 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRKCQQ04759 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRKCQQ04759 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRKCQQ04759 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRKCQQ04759 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRKCQQ04759 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRKCQQ04759 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRKCQQ04759 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PRKCQQ04759 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRKCQQ04759 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRKCQQ04759 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRKCQQ04759 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRKCQQ04759 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRKCQQ04759 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRKCQQ04759 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRKCQQ04759 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRKCQQ04759 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
PRKCQQ04759 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRKCQQ04759 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRKCQQ04759 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRKCQQ04759 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRKCQQ04759 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRKCQQ04759 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRKCQQ04759 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PRKCQQ04759 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PRKCQQ04759 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRKCQQ04759 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRKCQQ04759 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRKCQQ04759 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRKCQQ04759 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRKCQQ04759 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRKCQQ04759 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRKCQQ04759 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRKCQQ04759 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRKCQQ04759 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PRKCQQ04759 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRKCQQ04759 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRKCQQ04759 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PRKCQQ04759 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRKCQQ04759 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRKCQQ04759 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRKCQQ04759 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRKCQQ04759 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRKCQQ04759 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRKCQQ04759 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRKCQQ04759 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRKCQQ04759 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRKCQQ04759 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRKCQQ04759 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRKCQQ04759 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRKCQQ04759 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRKCQQ04759 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRKCQQ04759 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRKCQQ04759 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRKCQQ04759 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PRKCQQ04759 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRKCQQ04759 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRKCQQ04759 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRKCQQ04759 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PRKCQQ04759 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRKCQQ04759 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PRKCQQ04759 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRKCQQ04759 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRKCQQ04759 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms