Protein–RNA interactions for Protein: Q04742

Emx1, Homeobox protein EMX1, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx1Q04742 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Emx1Q04742 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Emx1Q04742 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Emx1Q04742 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Emx1Q04742 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Emx1Q04742 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Emx1Q04742 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Emx1Q04742 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Emx1Q04742 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Emx1Q04742 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Emx1Q04742 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Emx1Q04742 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Emx1Q04742 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Emx1Q04742 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Emx1Q04742 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Emx1Q04742 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Emx1Q04742 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Emx1Q04742 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Emx1Q04742 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Emx1Q04742 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Emx1Q04742 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Emx1Q04742 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Emx1Q04742 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Emx1Q04742 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Emx1Q04742 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Emx1Q04742 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Emx1Q04742 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Emx1Q04742 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Emx1Q04742 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Emx1Q04742 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Emx1Q04742 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Emx1Q04742 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Emx1Q04742 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Emx1Q04742 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Emx1Q04742 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Emx1Q04742 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Emx1Q04742 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Emx1Q04742 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Emx1Q04742 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Emx1Q04742 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Emx1Q04742 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Emx1Q04742 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Emx1Q04742 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Emx1Q04742 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Emx1Q04742 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Emx1Q04742 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Emx1Q04742 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Emx1Q04742 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Emx1Q04742 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Emx1Q04742 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Emx1Q04742 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Emx1Q04742 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Emx1Q04742 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Emx1Q04742 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Emx1Q04742 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Emx1Q04742 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Emx1Q04742 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Emx1Q04742 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Emx1Q04742 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Emx1Q04742 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Emx1Q04742 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Emx1Q04742 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Emx1Q04742 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Emx1Q04742 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Emx1Q04742 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Emx1Q04742 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Emx1Q04742 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Emx1Q04742 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Emx1Q04742 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Emx1Q04742 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Emx1Q04742 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Emx1Q04742 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Emx1Q04742 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Emx1Q04742 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Emx1Q04742 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Emx1Q04742 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Emx1Q04742 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Emx1Q04742 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Emx1Q04742 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Emx1Q04742 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Emx1Q04742 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Emx1Q04742 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Emx1Q04742 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Emx1Q04742 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Emx1Q04742 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Emx1Q04742 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Emx1Q04742 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Emx1Q04742 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Emx1Q04742 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Emx1Q04742 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Emx1Q04742 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Emx1Q04742 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Emx1Q04742 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Emx1Q04742 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Emx1Q04742 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Emx1Q04742 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Emx1Q04742 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Emx1Q04742 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Emx1Q04742 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Emx1Q04742 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms