Protein–RNA interactions for Protein: Q04228

UBX2, UBX domain-containing protein 2, yeastyeast

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Length 584 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBX2Q04228 SHH4YLR164W 507 nt11.84□□□□□ -0.51
UBX2Q04228 DUS1YML080W 1272 nt11.84□□□□□ -0.51
UBX2Q04228 RPM1RPM1 483 nt11.84□□□□□ -0.51
UBX2Q04228 STE4YOR212W 1272 nt11.84□□□□□ -0.51
UBX2Q04228 NRT1YOR071C 1797 nt11.83□□□□□ -0.52
UBX2Q04228 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt11.83□□□□□ -0.52
UBX2Q04228 RIB3YDR487C 627 nt11.81□□□□□ -0.52
UBX2Q04228 YML089CYML089C 369 nt11.8□□□□□ -0.52
UBX2Q04228 HIP1YGR191W 1812 nt11.79□□□□□ -0.52
UBX2Q04228 YNR029CYNR029C 1290 nt11.78□□□□□ -0.52
UBX2Q04228 MCH5YOR306C 1566 nt11.77□□□□□ -0.53
UBX2Q04228 AQY2YLL052C 450 nt11.76□□□□□ -0.53
UBX2Q04228 POM34YLR018C 900 nt11.76□□□□□ -0.53
UBX2Q04228 ADH7YCR105W 1086 nt11.75□□□□□ -0.53
UBX2Q04228 MET28YIR017C 564 nt11.74□□□□□ -0.53
UBX2Q04228 YLR349WYLR349W 507 nt11.74□□□□□ -0.53
UBX2Q04228 FUN14YAL008W 597 nt11.73□□□□□ -0.53
UBX2Q04228 YJL195CYJL195C 702 nt11.73□□□□□ -0.53
UBX2Q04228 PRO1YDR300C 1287 nt11.72□□□□□ -0.53
UBX2Q04228 LSC2YGR244C 1284 nt11.72□□□□□ -0.53
UBX2Q04228 ATG15YCR068W 1563 nt11.71□□□□□ -0.53
UBX2Q04228 CAB5YDR196C 726 nt11.71□□□□□ -0.53
UBX2Q04228 PAU15YIR041W 375 nt11.7□□□□□ -0.54
UBX2Q04228 SWE1YJL187C 2460 nt11.69□□□□□ -0.54
UBX2Q04228 YLR279WYLR279W 390 nt11.68□□□□□ -0.54
UBX2Q04228 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt11.68□□□□□ -0.54
UBX2Q04228 TIF6YPR016C 738 nt11.67□□□□□ -0.54
UBX2Q04228 FIT3YOR383C 615 nt11.66□□□□□ -0.54
UBX2Q04228 STR3YGL184C 1398 nt11.66□□□□□ -0.54
UBX2Q04228 YPI1YFR003C 468 nt11.62□□□□□ -0.55
UBX2Q04228 YCL074WYCL074W 927 nt11.61□□□□□ -0.55
UBX2Q04228 MSB4YOL112W 1479 nt11.61□□□□□ -0.55
UBX2Q04228 ADH1YOL086C 1047 nt11.6□□□□□ -0.55
UBX2Q04228 GPN2YOR262W 1044 nt11.58□□□□□ -0.56
UBX2Q04228 RDN18-1RDN18-1 1800 nt11.56□□□□□ -0.56
UBX2Q04228 RDN18-2RDN18-2 1800 nt11.56□□□□□ -0.56
UBX2Q04228 LOT5YKL183W 921 nt11.55□□□□□ -0.56
UBX2Q04228 YEL008WYEL008W 381 nt11.53□□□□□ -0.56
UBX2Q04228 ALG12YNR030W 1656 nt11.52□□□□□ -0.56
UBX2Q04228 GAP1YKR039W 1809 nt11.52□□□□□ -0.57
UBX2Q04228 CPD1YGR247W 720 nt11.52□□□□□ -0.57
UBX2Q04228 GND1YHR183W 1470 nt11.51□□□□□ -0.57
UBX2Q04228 ARP6YLR085C 1317 nt11.51□□□□□ -0.57
UBX2Q04228 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt11.5□□□□□ -0.57
UBX2Q04228 AAC1YMR056C 930 nt11.5□□□□□ -0.57
UBX2Q04228 HSP60YLR259C 1719 nt11.48□□□□□ -0.57
UBX2Q04228 RDN37-1RDN37-1 5354 nt11.47□□□□□ -0.57
UBX2Q04228 RDN37-2RDN37-2 5354 nt11.47□□□□□ -0.57
UBX2Q04228 RTN2YDL204W 1182 nt11.45□□□□□ -0.58
UBX2Q04228 ESS1YJR017C 513 nt11.44□□□□□ -0.58
UBX2Q04228 YAR028WYAR028W 705 nt11.42□□□□□ -0.58
UBX2Q04228 ALP1YNL270C 1722 nt11.42□□□□□ -0.58
UBX2Q04228 APT2YDR441C 546 nt11.41□□□□□ -0.58
UBX2Q04228 AKR2YOR034C 2250 nt11.4□□□□□ -0.58
UBX2Q04228 LSB3YFR024C-A 1380 nt11.38□□□□□ -0.59
UBX2Q04228 PLB1YMR008C 1995 nt11.37□□□□□ -0.59
UBX2Q04228 SMM1YNR015W 1155 nt11.36□□□□□ -0.59
UBX2Q04228 FUR4YBR021W 1902 nt11.35□□□□□ -0.59
UBX2Q04228 ZTA1YBR046C 1005 nt11.35□□□□□ -0.59
UBX2Q04228 DIF1YLR437C 402 nt11.34□□□□□ -0.59
UBX2Q04228 NAP1YKR048C 1254 nt11.31□□□□□ -0.6
UBX2Q04228 MTG2YHR168W 1557 nt11.3□□□□□ -0.6
UBX2Q04228 RIB2YOL066C 1776 nt11.29□□□□□ -0.6
UBX2Q04228 SEN2YLR105C 1134 nt11.27□□□□□ -0.61
UBX2Q04228 FCY21YER060W 1587 nt11.26□□□□□ -0.61
UBX2Q04228 SAM35YHR083W 990 nt11.24□□□□□ -0.61
UBX2Q04228 UTR1YJR049C 1593 nt11.24□□□□□ -0.61
UBX2Q04228 VRG4YGL225W 1014 nt11.23□□□□□ -0.61
UBX2Q04228 PRY1YJL079C 900 nt11.22□□□□□ -0.61
UBX2Q04228 NAR1YNL240C 1476 nt11.21□□□□□ -0.61
UBX2Q04228 SED1YDR077W 1017 nt11.19□□□□□ -0.62
UBX2Q04228 YGR259CYGR259C 441 nt11.19□□□□□ -0.62
UBX2Q04228 HXT12YIL170W 1374 nt11.18□□□□□ -0.62
UBX2Q04228 PRP4YPR178W 1398 nt11.17□□□□□ -0.62
UBX2Q04228 PAU5YFL020C 369 nt11.17□□□□□ -0.62
UBX2Q04228 PUP1YOR157C 786 nt11.16□□□□□ -0.62
UBX2Q04228 YKR005CYKR005C 1578 nt11.14□□□□□ -0.63
UBX2Q04228 PGC1YPL206C 966 nt11.12□□□□□ -0.63
UBX2Q04228 UGA4YDL210W 1716 nt11.12□□□□□ -0.63
UBX2Q04228 DPS1YLL018C 1674 nt11.11□□□□□ -0.63
UBX2Q04228 Q0182Q0182 405 nt11.11□□□□□ -0.63
UBX2Q04228 YJL055WYJL055W 738 nt11.11□□□□□ -0.63
UBX2Q04228 STP3YLR375W 1032 nt11.1□□□□□ -0.63
UBX2Q04228 ALD4YOR374W 1560 nt11.1□□□□□ -0.63
UBX2Q04228 YER190C-AYER190C-A 576 nt11.09□□□□□ -0.63
UBX2Q04228 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt11.09□□□□□ -0.63
UBX2Q04228 YML133W-AYML133W-A 576 nt11.09□□□□□ -0.63
UBX2Q04228 LIP1YMR298W 453 nt11.09□□□□□ -0.63
UBX2Q04228 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt11.09□□□□□ -0.63
UBX2Q04228 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt11.09□□□□□ -0.63
UBX2Q04228 YBR232CYBR232C 360 nt11.08□□□□□ -0.64
UBX2Q04228 BMT6YLR063W 1098 nt11.06□□□□□ -0.64
UBX2Q04228 TAF13YML098W 504 nt11.05□□□□□ -0.64
UBX2Q04228 CCT5YJR064W 1689 nt11.04□□□□□ -0.64
UBX2Q04228 PRM5YIL117C 957 nt11.03□□□□□ -0.64
UBX2Q04228 YJL064WYJL064W 396 nt11.03□□□□□ -0.64
UBX2Q04228 LSB5YCL034W 1065 nt11.03□□□□□ -0.64
UBX2Q04228 MEP3YPR138C 1470 nt11□□□□□ -0.65
UBX2Q04228 THI72YOR192C 1800 nt11□□□□□ -0.65
UBX2Q04228 PAU19YMR325W 375 nt10.99□□□□□ -0.65
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