Protein–RNA interactions for Protein: Q03591

CFHR1, Complement factor H-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFHR1Q03591 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CFHR1Q03591 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CFHR1Q03591 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CFHR1Q03591 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CFHR1Q03591 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CFHR1Q03591 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CFHR1Q03591 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CFHR1Q03591 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CFHR1Q03591 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CFHR1Q03591 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CFHR1Q03591 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CFHR1Q03591 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CFHR1Q03591 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CFHR1Q03591 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CFHR1Q03591 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CFHR1Q03591 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CFHR1Q03591 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CFHR1Q03591 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CFHR1Q03591 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CFHR1Q03591 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CFHR1Q03591 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CFHR1Q03591 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CFHR1Q03591 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CFHR1Q03591 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CFHR1Q03591 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CFHR1Q03591 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CFHR1Q03591 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CFHR1Q03591 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CFHR1Q03591 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CFHR1Q03591 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CFHR1Q03591 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CFHR1Q03591 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CFHR1Q03591 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CFHR1Q03591 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CFHR1Q03591 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CFHR1Q03591 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CFHR1Q03591 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CFHR1Q03591 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CFHR1Q03591 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CFHR1Q03591 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CFHR1Q03591 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CFHR1Q03591 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CFHR1Q03591 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CFHR1Q03591 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CFHR1Q03591 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CFHR1Q03591 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CFHR1Q03591 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CFHR1Q03591 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CFHR1Q03591 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CFHR1Q03591 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CFHR1Q03591 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CFHR1Q03591 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CFHR1Q03591 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CFHR1Q03591 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CFHR1Q03591 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CFHR1Q03591 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CFHR1Q03591 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CFHR1Q03591 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CFHR1Q03591 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CFHR1Q03591 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CFHR1Q03591 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CFHR1Q03591 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CFHR1Q03591 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CFHR1Q03591 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CFHR1Q03591 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CFHR1Q03591 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CFHR1Q03591 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CFHR1Q03591 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CFHR1Q03591 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CFHR1Q03591 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CFHR1Q03591 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CFHR1Q03591 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CFHR1Q03591 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CFHR1Q03591 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CFHR1Q03591 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CFHR1Q03591 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CFHR1Q03591 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CFHR1Q03591 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CFHR1Q03591 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CFHR1Q03591 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CFHR1Q03591 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CFHR1Q03591 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CFHR1Q03591 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CFHR1Q03591 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CFHR1Q03591 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CFHR1Q03591 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CFHR1Q03591 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CFHR1Q03591 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CFHR1Q03591 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CFHR1Q03591 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CFHR1Q03591 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CFHR1Q03591 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CFHR1Q03591 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CFHR1Q03591 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CFHR1Q03591 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CFHR1Q03591 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CFHR1Q03591 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CFHR1Q03591 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CFHR1Q03591 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CFHR1Q03591 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms