Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ddr1Q03146 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ddr1Q03146 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ddr1Q03146 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ddr1Q03146 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ddr1Q03146 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ddr1Q03146 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ddr1Q03146 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ddr1Q03146 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ddr1Q03146 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ddr1Q03146 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ddr1Q03146 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ddr1Q03146 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ddr1Q03146 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ddr1Q03146 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ddr1Q03146 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ddr1Q03146 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ddr1Q03146 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ddr1Q03146 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ddr1Q03146 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ddr1Q03146 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Ddr1Q03146 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ddr1Q03146 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ddr1Q03146 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ddr1Q03146 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ddr1Q03146 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ddr1Q03146 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ddr1Q03146 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ddr1Q03146 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ddr1Q03146 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ddr1Q03146 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ddr1Q03146 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Ddr1Q03146 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ddr1Q03146 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ddr1Q03146 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Ddr1Q03146 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ddr1Q03146 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ddr1Q03146 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Ddr1Q03146 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ddr1Q03146 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ddr1Q03146 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ddr1Q03146 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ddr1Q03146 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ddr1Q03146 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ddr1Q03146 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ddr1Q03146 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ddr1Q03146 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ddr1Q03146 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ddr1Q03146 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ddr1Q03146 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ddr1Q03146 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ddr1Q03146 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ddr1Q03146 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ddr1Q03146 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ddr1Q03146 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ddr1Q03146 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ddr1Q03146 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ddr1Q03146 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ddr1Q03146 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ddr1Q03146 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ddr1Q03146 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ddr1Q03146 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ddr1Q03146 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ddr1Q03146 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ddr1Q03146 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ddr1Q03146 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ddr1Q03146 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Ddr1Q03146 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ddr1Q03146 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ddr1Q03146 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Ddr1Q03146 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ddr1Q03146 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ddr1Q03146 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ddr1Q03146 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Ddr1Q03146 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ddr1Q03146 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ddr1Q03146 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ddr1Q03146 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ddr1Q03146 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ddr1Q03146 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ddr1Q03146 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ddr1Q03146 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ddr1Q03146 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ddr1Q03146 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ddr1Q03146 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ddr1Q03146 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ddr1Q03146 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ddr1Q03146 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ddr1Q03146 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ddr1Q03146 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ddr1Q03146 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ddr1Q03146 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ddr1Q03146 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ddr1Q03146 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Ddr1Q03146 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ddr1Q03146 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ddr1Q03146 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Ddr1Q03146 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ddr1Q03146 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ddr1Q03146 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms