Protein–RNA interactions for Protein: Q02962

PAX2, Paired box protein Pax-2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX2Q02962 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAX2Q02962 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAX2Q02962 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PAX2Q02962 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAX2Q02962 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAX2Q02962 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAX2Q02962 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAX2Q02962 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAX2Q02962 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAX2Q02962 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAX2Q02962 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAX2Q02962 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAX2Q02962 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAX2Q02962 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAX2Q02962 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAX2Q02962 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAX2Q02962 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAX2Q02962 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAX2Q02962 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAX2Q02962 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PAX2Q02962 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PAX2Q02962 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PAX2Q02962 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAX2Q02962 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAX2Q02962 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAX2Q02962 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAX2Q02962 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAX2Q02962 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAX2Q02962 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAX2Q02962 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAX2Q02962 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PAX2Q02962 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAX2Q02962 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAX2Q02962 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAX2Q02962 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PAX2Q02962 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PAX2Q02962 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PAX2Q02962 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PAX2Q02962 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAX2Q02962 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAX2Q02962 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAX2Q02962 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAX2Q02962 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAX2Q02962 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PAX2Q02962 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAX2Q02962 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAX2Q02962 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PAX2Q02962 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PAX2Q02962 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PAX2Q02962 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PAX2Q02962 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PAX2Q02962 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PAX2Q02962 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAX2Q02962 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAX2Q02962 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAX2Q02962 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAX2Q02962 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAX2Q02962 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAX2Q02962 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAX2Q02962 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAX2Q02962 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAX2Q02962 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAX2Q02962 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAX2Q02962 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAX2Q02962 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAX2Q02962 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAX2Q02962 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAX2Q02962 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAX2Q02962 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAX2Q02962 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAX2Q02962 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAX2Q02962 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAX2Q02962 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAX2Q02962 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAX2Q02962 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAX2Q02962 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PAX2Q02962 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAX2Q02962 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAX2Q02962 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAX2Q02962 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PAX2Q02962 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAX2Q02962 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAX2Q02962 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAX2Q02962 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAX2Q02962 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAX2Q02962 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAX2Q02962 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAX2Q02962 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAX2Q02962 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAX2Q02962 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAX2Q02962 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAX2Q02962 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAX2Q02962 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAX2Q02962 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAX2Q02962 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAX2Q02962 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAX2Q02962 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAX2Q02962 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAX2Q02962 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAX2Q02962 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.5 ms