Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CACNB1Q02641 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
CACNB1Q02641 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CACNB1Q02641 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CACNB1Q02641 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CACNB1Q02641 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CACNB1Q02641 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
CACNB1Q02641 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CACNB1Q02641 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CACNB1Q02641 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CACNB1Q02641 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CACNB1Q02641 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CACNB1Q02641 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CACNB1Q02641 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CACNB1Q02641 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CACNB1Q02641 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CACNB1Q02641 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CACNB1Q02641 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CACNB1Q02641 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CACNB1Q02641 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CACNB1Q02641 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CACNB1Q02641 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CACNB1Q02641 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CACNB1Q02641 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CACNB1Q02641 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CACNB1Q02641 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CACNB1Q02641 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CACNB1Q02641 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
CACNB1Q02641 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CACNB1Q02641 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CACNB1Q02641 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CACNB1Q02641 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
CACNB1Q02641 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CACNB1Q02641 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CACNB1Q02641 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CACNB1Q02641 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CACNB1Q02641 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CACNB1Q02641 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CACNB1Q02641 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
CACNB1Q02641 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
CACNB1Q02641 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CACNB1Q02641 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CACNB1Q02641 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CACNB1Q02641 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CACNB1Q02641 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CACNB1Q02641 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CACNB1Q02641 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
CACNB1Q02641 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CACNB1Q02641 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CACNB1Q02641 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CACNB1Q02641 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CACNB1Q02641 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CACNB1Q02641 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CACNB1Q02641 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CACNB1Q02641 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CACNB1Q02641 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CACNB1Q02641 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CACNB1Q02641 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CACNB1Q02641 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CACNB1Q02641 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CACNB1Q02641 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CACNB1Q02641 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CACNB1Q02641 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
CACNB1Q02641 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CACNB1Q02641 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CACNB1Q02641 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CACNB1Q02641 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CACNB1Q02641 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CACNB1Q02641 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CACNB1Q02641 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CACNB1Q02641 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CACNB1Q02641 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CACNB1Q02641 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CACNB1Q02641 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CACNB1Q02641 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CACNB1Q02641 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CACNB1Q02641 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CACNB1Q02641 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CACNB1Q02641 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CACNB1Q02641 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CACNB1Q02641 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CACNB1Q02641 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CACNB1Q02641 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CACNB1Q02641 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CACNB1Q02641 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CACNB1Q02641 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CACNB1Q02641 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CACNB1Q02641 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CACNB1Q02641 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CACNB1Q02641 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
CACNB1Q02641 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CACNB1Q02641 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CACNB1Q02641 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CACNB1Q02641 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CACNB1Q02641 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CACNB1Q02641 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CACNB1Q02641 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CACNB1Q02641 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CACNB1Q02641 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CACNB1Q02641 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms