Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
APBA1Q02410 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
APBA1Q02410 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
APBA1Q02410 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
APBA1Q02410 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
APBA1Q02410 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
APBA1Q02410 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
APBA1Q02410 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
APBA1Q02410 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
APBA1Q02410 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
APBA1Q02410 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
APBA1Q02410 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
APBA1Q02410 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
APBA1Q02410 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
APBA1Q02410 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
APBA1Q02410 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
APBA1Q02410 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
APBA1Q02410 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
APBA1Q02410 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
APBA1Q02410 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
APBA1Q02410 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
APBA1Q02410 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
APBA1Q02410 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
APBA1Q02410 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
APBA1Q02410 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
APBA1Q02410 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
APBA1Q02410 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
APBA1Q02410 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
APBA1Q02410 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
APBA1Q02410 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
APBA1Q02410 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
APBA1Q02410 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
APBA1Q02410 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
APBA1Q02410 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
APBA1Q02410 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
APBA1Q02410 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
APBA1Q02410 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
APBA1Q02410 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
APBA1Q02410 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
APBA1Q02410 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
APBA1Q02410 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
APBA1Q02410 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
APBA1Q02410 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
APBA1Q02410 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
APBA1Q02410 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
APBA1Q02410 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
APBA1Q02410 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
APBA1Q02410 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
APBA1Q02410 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
APBA1Q02410 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
APBA1Q02410 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
APBA1Q02410 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
APBA1Q02410 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
APBA1Q02410 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
APBA1Q02410 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
APBA1Q02410 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
APBA1Q02410 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
APBA1Q02410 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
APBA1Q02410 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
APBA1Q02410 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
APBA1Q02410 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
APBA1Q02410 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
APBA1Q02410 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
APBA1Q02410 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
APBA1Q02410 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
APBA1Q02410 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
APBA1Q02410 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
APBA1Q02410 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
APBA1Q02410 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
APBA1Q02410 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
APBA1Q02410 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
APBA1Q02410 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
APBA1Q02410 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
APBA1Q02410 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
APBA1Q02410 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
APBA1Q02410 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
APBA1Q02410 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
APBA1Q02410 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
APBA1Q02410 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
APBA1Q02410 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
APBA1Q02410 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
APBA1Q02410 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
APBA1Q02410 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
APBA1Q02410 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
APBA1Q02410 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
APBA1Q02410 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
APBA1Q02410 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
APBA1Q02410 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
APBA1Q02410 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
APBA1Q02410 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29■■■□□ 2.23
APBA1Q02410 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29■■■□□ 2.23
APBA1Q02410 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
APBA1Q02410 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
APBA1Q02410 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
APBA1Q02410 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
APBA1Q02410 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
APBA1Q02410 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
APBA1Q02410 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
APBA1Q02410 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
APBA1Q02410 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms