Protein–RNA interactions for Protein: Q01459

CTBS, Di-N-acetylchitobiase, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBSQ01459 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CTBSQ01459 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CTBSQ01459 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CTBSQ01459 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CTBSQ01459 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CTBSQ01459 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CTBSQ01459 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CTBSQ01459 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CTBSQ01459 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CTBSQ01459 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CTBSQ01459 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CTBSQ01459 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CTBSQ01459 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CTBSQ01459 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTBSQ01459 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CTBSQ01459 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTBSQ01459 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTBSQ01459 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTBSQ01459 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CTBSQ01459 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTBSQ01459 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CTBSQ01459 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTBSQ01459 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CTBSQ01459 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTBSQ01459 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTBSQ01459 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTBSQ01459 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CTBSQ01459 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CTBSQ01459 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CTBSQ01459 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CTBSQ01459 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CTBSQ01459 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CTBSQ01459 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CTBSQ01459 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTBSQ01459 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTBSQ01459 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CTBSQ01459 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTBSQ01459 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTBSQ01459 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CTBSQ01459 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CTBSQ01459 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CTBSQ01459 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CTBSQ01459 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTBSQ01459 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTBSQ01459 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTBSQ01459 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTBSQ01459 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CTBSQ01459 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CTBSQ01459 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CTBSQ01459 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CTBSQ01459 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CTBSQ01459 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CTBSQ01459 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CTBSQ01459 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CTBSQ01459 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CTBSQ01459 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CTBSQ01459 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CTBSQ01459 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CTBSQ01459 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CTBSQ01459 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CTBSQ01459 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CTBSQ01459 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CTBSQ01459 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CTBSQ01459 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CTBSQ01459 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CTBSQ01459 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CTBSQ01459 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CTBSQ01459 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CTBSQ01459 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CTBSQ01459 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CTBSQ01459 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CTBSQ01459 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CTBSQ01459 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CTBSQ01459 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CTBSQ01459 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CTBSQ01459 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CTBSQ01459 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CTBSQ01459 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CTBSQ01459 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CTBSQ01459 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CTBSQ01459 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CTBSQ01459 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CTBSQ01459 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CTBSQ01459 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CTBSQ01459 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CTBSQ01459 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CTBSQ01459 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CTBSQ01459 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CTBSQ01459 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CTBSQ01459 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CTBSQ01459 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CTBSQ01459 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CTBSQ01459 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CTBSQ01459 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CTBSQ01459 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CTBSQ01459 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CTBSQ01459 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CTBSQ01459 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CTBSQ01459 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTBSQ01459 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms