Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
E2F1Q01094 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
E2F1Q01094 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
E2F1Q01094 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
E2F1Q01094 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
E2F1Q01094 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
E2F1Q01094 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
E2F1Q01094 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
E2F1Q01094 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
E2F1Q01094 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
E2F1Q01094 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
E2F1Q01094 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
E2F1Q01094 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
E2F1Q01094 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
E2F1Q01094 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
E2F1Q01094 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
E2F1Q01094 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
E2F1Q01094 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
E2F1Q01094 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
E2F1Q01094 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
E2F1Q01094 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
E2F1Q01094 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
E2F1Q01094 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
E2F1Q01094 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
E2F1Q01094 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
E2F1Q01094 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
E2F1Q01094 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
E2F1Q01094 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
E2F1Q01094 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
E2F1Q01094 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
E2F1Q01094 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
E2F1Q01094 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
E2F1Q01094 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
E2F1Q01094 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
E2F1Q01094 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
E2F1Q01094 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
E2F1Q01094 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
E2F1Q01094 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
E2F1Q01094 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
E2F1Q01094 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
E2F1Q01094 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
E2F1Q01094 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
E2F1Q01094 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
E2F1Q01094 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
E2F1Q01094 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
E2F1Q01094 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
E2F1Q01094 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
E2F1Q01094 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
E2F1Q01094 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
E2F1Q01094 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
E2F1Q01094 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
E2F1Q01094 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
E2F1Q01094 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
E2F1Q01094 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
E2F1Q01094 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
E2F1Q01094 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
E2F1Q01094 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
E2F1Q01094 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
E2F1Q01094 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
E2F1Q01094 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
E2F1Q01094 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
E2F1Q01094 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
E2F1Q01094 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
E2F1Q01094 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
E2F1Q01094 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
E2F1Q01094 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
E2F1Q01094 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
E2F1Q01094 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
E2F1Q01094 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
E2F1Q01094 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
E2F1Q01094 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
E2F1Q01094 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
E2F1Q01094 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
E2F1Q01094 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
E2F1Q01094 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
E2F1Q01094 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
E2F1Q01094 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
E2F1Q01094 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
E2F1Q01094 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
E2F1Q01094 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
E2F1Q01094 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
E2F1Q01094 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
E2F1Q01094 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
E2F1Q01094 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
E2F1Q01094 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
E2F1Q01094 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
E2F1Q01094 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
E2F1Q01094 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
E2F1Q01094 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
E2F1Q01094 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
E2F1Q01094 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
E2F1Q01094 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
E2F1Q01094 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
E2F1Q01094 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
E2F1Q01094 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
E2F1Q01094 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
E2F1Q01094 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
E2F1Q01094 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
E2F1Q01094 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
E2F1Q01094 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms