Protein–RNA interactions for Protein: Q00780

Col8a1, Collagen alpha-1(VIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col8a1Q00780 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Col8a1Q00780 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Col8a1Q00780 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Col8a1Q00780 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Col8a1Q00780 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Col8a1Q00780 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col8a1Q00780 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col8a1Q00780 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Col8a1Q00780 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Col8a1Q00780 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Col8a1Q00780 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Col8a1Q00780 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Col8a1Q00780 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Col8a1Q00780 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Col8a1Q00780 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Col8a1Q00780 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Col8a1Q00780 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Col8a1Q00780 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Col8a1Q00780 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Col8a1Q00780 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Col8a1Q00780 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Col8a1Q00780 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Col8a1Q00780 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Col8a1Q00780 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Col8a1Q00780 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col8a1Q00780 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col8a1Q00780 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Col8a1Q00780 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col8a1Q00780 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col8a1Q00780 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Col8a1Q00780 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col8a1Q00780 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col8a1Q00780 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col8a1Q00780 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col8a1Q00780 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Col8a1Q00780 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Col8a1Q00780 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Col8a1Q00780 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Col8a1Q00780 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Col8a1Q00780 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Col8a1Q00780 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col8a1Q00780 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col8a1Q00780 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col8a1Q00780 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col8a1Q00780 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col8a1Q00780 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Col8a1Q00780 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col8a1Q00780 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col8a1Q00780 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col8a1Q00780 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Col8a1Q00780 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Col8a1Q00780 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Col8a1Q00780 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Col8a1Q00780 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Col8a1Q00780 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Col8a1Q00780 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Col8a1Q00780 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Col8a1Q00780 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Col8a1Q00780 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col8a1Q00780 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col8a1Q00780 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col8a1Q00780 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col8a1Q00780 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col8a1Q00780 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Col8a1Q00780 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col8a1Q00780 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col8a1Q00780 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Col8a1Q00780 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Col8a1Q00780 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Col8a1Q00780 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Col8a1Q00780 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col8a1Q00780 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col8a1Q00780 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col8a1Q00780 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col8a1Q00780 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col8a1Q00780 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col8a1Q00780 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col8a1Q00780 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col8a1Q00780 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col8a1Q00780 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col8a1Q00780 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col8a1Q00780 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col8a1Q00780 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col8a1Q00780 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col8a1Q00780 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col8a1Q00780 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Col8a1Q00780 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col8a1Q00780 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col8a1Q00780 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col8a1Q00780 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col8a1Q00780 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col8a1Q00780 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col8a1Q00780 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col8a1Q00780 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Col8a1Q00780 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col8a1Q00780 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col8a1Q00780 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col8a1Q00780 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col8a1Q00780 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col8a1Q00780 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms