Protein–RNA interactions for Protein: P98196

ATP11A, Probable phospholipid-transporting ATPase IH, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP11AP98196 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATP11AP98196 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATP11AP98196 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATP11AP98196 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATP11AP98196 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATP11AP98196 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATP11AP98196 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATP11AP98196 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
ATP11AP98196 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
ATP11AP98196 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATP11AP98196 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATP11AP98196 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATP11AP98196 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATP11AP98196 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP11AP98196 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP11AP98196 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ATP11AP98196 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ATP11AP98196 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATP11AP98196 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP11AP98196 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP11AP98196 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP11AP98196 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP11AP98196 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATP11AP98196 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP11AP98196 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP11AP98196 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP11AP98196 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP11AP98196 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP11AP98196 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP11AP98196 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP11AP98196 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP11AP98196 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP11AP98196 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATP11AP98196 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATP11AP98196 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATP11AP98196 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATP11AP98196 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATP11AP98196 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATP11AP98196 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
ATP11AP98196 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP11AP98196 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP11AP98196 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP11AP98196 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATP11AP98196 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATP11AP98196 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP11AP98196 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP11AP98196 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP11AP98196 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATP11AP98196 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATP11AP98196 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATP11AP98196 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATP11AP98196 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATP11AP98196 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATP11AP98196 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATP11AP98196 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATP11AP98196 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATP11AP98196 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATP11AP98196 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATP11AP98196 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATP11AP98196 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ATP11AP98196 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
ATP11AP98196 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATP11AP98196 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATP11AP98196 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATP11AP98196 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATP11AP98196 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
ATP11AP98196 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ATP11AP98196 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP11AP98196 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP11AP98196 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP11AP98196 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP11AP98196 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP11AP98196 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP11AP98196 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP11AP98196 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP11AP98196 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP11AP98196 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP11AP98196 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP11AP98196 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP11AP98196 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP11AP98196 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP11AP98196 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP11AP98196 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP11AP98196 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP11AP98196 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP11AP98196 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP11AP98196 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP11AP98196 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP11AP98196 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP11AP98196 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP11AP98196 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP11AP98196 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP11AP98196 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP11AP98196 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP11AP98196 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP11AP98196 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP11AP98196 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP11AP98196 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP11AP98196 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP11AP98196 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms