Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM3AP98173 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM3AP98173 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM3AP98173 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM3AP98173 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM3AP98173 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM3AP98173 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM3AP98173 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM3AP98173 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM3AP98173 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM3AP98173 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM3AP98173 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM3AP98173 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM3AP98173 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM3AP98173 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM3AP98173 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM3AP98173 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM3AP98173 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM3AP98173 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM3AP98173 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM3AP98173 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM3AP98173 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM3AP98173 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM3AP98173 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM3AP98173 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM3AP98173 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM3AP98173 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM3AP98173 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM3AP98173 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM3AP98173 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM3AP98173 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM3AP98173 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM3AP98173 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM3AP98173 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM3AP98173 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM3AP98173 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM3AP98173 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM3AP98173 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM3AP98173 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM3AP98173 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM3AP98173 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM3AP98173 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM3AP98173 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM3AP98173 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM3AP98173 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM3AP98173 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM3AP98173 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM3AP98173 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM3AP98173 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM3AP98173 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM3AP98173 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM3AP98173 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM3AP98173 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM3AP98173 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM3AP98173 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM3AP98173 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM3AP98173 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM3AP98173 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM3AP98173 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM3AP98173 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM3AP98173 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM3AP98173 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM3AP98173 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FAM3AP98173 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM3AP98173 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM3AP98173 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM3AP98173 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM3AP98173 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM3AP98173 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM3AP98173 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM3AP98173 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM3AP98173 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM3AP98173 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM3AP98173 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM3AP98173 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM3AP98173 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM3AP98173 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM3AP98173 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM3AP98173 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM3AP98173 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM3AP98173 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
FAM3AP98173 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM3AP98173 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM3AP98173 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM3AP98173 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM3AP98173 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM3AP98173 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM3AP98173 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM3AP98173 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM3AP98173 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM3AP98173 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM3AP98173 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM3AP98173 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM3AP98173 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM3AP98173 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM3AP98173 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM3AP98173 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM3AP98173 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM3AP98173 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FAM3AP98173 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 219.3 ms