Protein–RNA interactions for Protein: P97946

Vegfd, Vascular endothelial growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfdP97946 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VegfdP97946 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VegfdP97946 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VegfdP97946 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VegfdP97946 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VegfdP97946 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VegfdP97946 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VegfdP97946 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
VegfdP97946 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
VegfdP97946 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
VegfdP97946 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VegfdP97946 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VegfdP97946 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VegfdP97946 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VegfdP97946 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VegfdP97946 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VegfdP97946 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VegfdP97946 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VegfdP97946 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VegfdP97946 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VegfdP97946 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VegfdP97946 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VegfdP97946 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VegfdP97946 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VegfdP97946 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VegfdP97946 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VegfdP97946 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VegfdP97946 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VegfdP97946 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VegfdP97946 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VegfdP97946 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
VegfdP97946 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VegfdP97946 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VegfdP97946 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VegfdP97946 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VegfdP97946 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VegfdP97946 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VegfdP97946 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VegfdP97946 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VegfdP97946 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VegfdP97946 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VegfdP97946 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VegfdP97946 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VegfdP97946 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VegfdP97946 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
VegfdP97946 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
VegfdP97946 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VegfdP97946 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VegfdP97946 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VegfdP97946 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VegfdP97946 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VegfdP97946 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VegfdP97946 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VegfdP97946 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VegfdP97946 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VegfdP97946 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VegfdP97946 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VegfdP97946 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VegfdP97946 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
VegfdP97946 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VegfdP97946 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VegfdP97946 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VegfdP97946 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VegfdP97946 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VegfdP97946 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VegfdP97946 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VegfdP97946 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VegfdP97946 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VegfdP97946 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VegfdP97946 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VegfdP97946 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VegfdP97946 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VegfdP97946 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
VegfdP97946 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VegfdP97946 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VegfdP97946 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VegfdP97946 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VegfdP97946 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VegfdP97946 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VegfdP97946 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VegfdP97946 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VegfdP97946 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VegfdP97946 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VegfdP97946 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VegfdP97946 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
VegfdP97946 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
VegfdP97946 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VegfdP97946 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VegfdP97946 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VegfdP97946 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VegfdP97946 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VegfdP97946 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VegfdP97946 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VegfdP97946 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VegfdP97946 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
VegfdP97946 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VegfdP97946 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VegfdP97946 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VegfdP97946 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VegfdP97946 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms