Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cited1P97769 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cited1P97769 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cited1P97769 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cited1P97769 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cited1P97769 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cited1P97769 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cited1P97769 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cited1P97769 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cited1P97769 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cited1P97769 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cited1P97769 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Cited1P97769 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cited1P97769 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cited1P97769 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cited1P97769 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cited1P97769 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cited1P97769 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Cited1P97769 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cited1P97769 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cited1P97769 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cited1P97769 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cited1P97769 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cited1P97769 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cited1P97769 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cited1P97769 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cited1P97769 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cited1P97769 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cited1P97769 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cited1P97769 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cited1P97769 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cited1P97769 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cited1P97769 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cited1P97769 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cited1P97769 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cited1P97769 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cited1P97769 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cited1P97769 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cited1P97769 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cited1P97769 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cited1P97769 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cited1P97769 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cited1P97769 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Cited1P97769 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cited1P97769 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cited1P97769 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cited1P97769 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cited1P97769 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cited1P97769 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cited1P97769 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cited1P97769 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cited1P97769 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cited1P97769 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cited1P97769 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cited1P97769 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cited1P97769 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cited1P97769 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cited1P97769 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cited1P97769 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cited1P97769 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cited1P97769 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Cited1P97769 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cited1P97769 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cited1P97769 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cited1P97769 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cited1P97769 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cited1P97769 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cited1P97769 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cited1P97769 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cited1P97769 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cited1P97769 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cited1P97769 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cited1P97769 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cited1P97769 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cited1P97769 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cited1P97769 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cited1P97769 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cited1P97769 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cited1P97769 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cited1P97769 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cited1P97769 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cited1P97769 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cited1P97769 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cited1P97769 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cited1P97769 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cited1P97769 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cited1P97769 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cited1P97769 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cited1P97769 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cited1P97769 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cited1P97769 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cited1P97769 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cited1P97769 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cited1P97769 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cited1P97769 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cited1P97769 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cited1P97769 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cited1P97769 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cited1P97769 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cited1P97769 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms