Protein–RNA interactions for Protein: P97489

Gata5, Transcription factor GATA-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata5P97489 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gata5P97489 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gata5P97489 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Gata5P97489 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gata5P97489 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gata5P97489 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gata5P97489 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gata5P97489 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gata5P97489 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gata5P97489 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gata5P97489 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gata5P97489 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gata5P97489 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gata5P97489 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gata5P97489 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Gata5P97489 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gata5P97489 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gata5P97489 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gata5P97489 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gata5P97489 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gata5P97489 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gata5P97489 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gata5P97489 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gata5P97489 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gata5P97489 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gata5P97489 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gata5P97489 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gata5P97489 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gata5P97489 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gata5P97489 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gata5P97489 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gata5P97489 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gata5P97489 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gata5P97489 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gata5P97489 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gata5P97489 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gata5P97489 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gata5P97489 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gata5P97489 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gata5P97489 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gata5P97489 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gata5P97489 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gata5P97489 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gata5P97489 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gata5P97489 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gata5P97489 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gata5P97489 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gata5P97489 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gata5P97489 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gata5P97489 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gata5P97489 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gata5P97489 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gata5P97489 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gata5P97489 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gata5P97489 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gata5P97489 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Gata5P97489 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gata5P97489 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gata5P97489 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gata5P97489 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gata5P97489 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gata5P97489 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gata5P97489 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gata5P97489 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gata5P97489 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gata5P97489 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gata5P97489 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gata5P97489 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gata5P97489 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gata5P97489 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gata5P97489 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gata5P97489 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Gata5P97489 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gata5P97489 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gata5P97489 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gata5P97489 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gata5P97489 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gata5P97489 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gata5P97489 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gata5P97489 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gata5P97489 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gata5P97489 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gata5P97489 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gata5P97489 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Gata5P97489 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gata5P97489 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gata5P97489 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Gata5P97489 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gata5P97489 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Gata5P97489 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gata5P97489 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gata5P97489 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gata5P97489 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gata5P97489 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gata5P97489 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gata5P97489 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gata5P97489 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gata5P97489 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gata5P97489 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gata5P97489 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms