Protein–RNA interactions for Protein: P84228

Hist1h3b, Histone H3.2, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hist1h3bP84228 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hist1h3bP84228 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hist1h3bP84228 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hist1h3bP84228 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hist1h3bP84228 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hist1h3bP84228 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hist1h3bP84228 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hist1h3bP84228 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hist1h3bP84228 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hist1h3bP84228 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Hist1h3bP84228 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hist1h3bP84228 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hist1h3bP84228 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hist1h3bP84228 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hist1h3bP84228 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hist1h3bP84228 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Hist1h3bP84228 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hist1h3bP84228 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hist1h3bP84228 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hist1h3bP84228 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hist1h3bP84228 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hist1h3bP84228 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hist1h3bP84228 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hist1h3bP84228 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hist1h3bP84228 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hist1h3bP84228 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Hist1h3bP84228 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hist1h3bP84228 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hist1h3bP84228 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hist1h3bP84228 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hist1h3bP84228 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hist1h3bP84228 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hist1h3bP84228 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hist1h3bP84228 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hist1h3bP84228 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hist1h3bP84228 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Hist1h3bP84228 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hist1h3bP84228 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hist1h3bP84228 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hist1h3bP84228 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hist1h3bP84228 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hist1h3bP84228 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hist1h3bP84228 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hist1h3bP84228 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hist1h3bP84228 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hist1h3bP84228 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hist1h3bP84228 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hist1h3bP84228 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hist1h3bP84228 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hist1h3bP84228 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hist1h3bP84228 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hist1h3bP84228 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Hist1h3bP84228 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Hist1h3bP84228 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hist1h3bP84228 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hist1h3bP84228 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hist1h3bP84228 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hist1h3bP84228 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Hist1h3bP84228 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hist1h3bP84228 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hist1h3bP84228 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hist1h3bP84228 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Hist1h3bP84228 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hist1h3bP84228 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hist1h3bP84228 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hist1h3bP84228 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hist1h3bP84228 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hist1h3bP84228 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hist1h3bP84228 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hist1h3bP84228 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hist1h3bP84228 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hist1h3bP84228 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hist1h3bP84228 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hist1h3bP84228 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hist1h3bP84228 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hist1h3bP84228 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hist1h3bP84228 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hist1h3bP84228 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hist1h3bP84228 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hist1h3bP84228 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hist1h3bP84228 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hist1h3bP84228 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hist1h3bP84228 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hist1h3bP84228 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hist1h3bP84228 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hist1h3bP84228 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hist1h3bP84228 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hist1h3bP84228 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Hist1h3bP84228 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hist1h3bP84228 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hist1h3bP84228 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hist1h3bP84228 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hist1h3bP84228 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hist1h3bP84228 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hist1h3bP84228 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hist1h3bP84228 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hist1h3bP84228 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hist1h3bP84228 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hist1h3bP84228 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hist1h3bP84228 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms