Protein–RNA interactions for Protein: P84075

Hpca, Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HpcaP84075 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HpcaP84075 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HpcaP84075 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HpcaP84075 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HpcaP84075 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HpcaP84075 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HpcaP84075 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
HpcaP84075 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HpcaP84075 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HpcaP84075 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HpcaP84075 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HpcaP84075 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HpcaP84075 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HpcaP84075 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HpcaP84075 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HpcaP84075 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HpcaP84075 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HpcaP84075 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HpcaP84075 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HpcaP84075 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HpcaP84075 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HpcaP84075 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HpcaP84075 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HpcaP84075 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HpcaP84075 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HpcaP84075 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HpcaP84075 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HpcaP84075 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HpcaP84075 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HpcaP84075 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HpcaP84075 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HpcaP84075 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HpcaP84075 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HpcaP84075 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HpcaP84075 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HpcaP84075 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HpcaP84075 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HpcaP84075 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HpcaP84075 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HpcaP84075 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HpcaP84075 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HpcaP84075 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HpcaP84075 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HpcaP84075 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HpcaP84075 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HpcaP84075 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HpcaP84075 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
HpcaP84075 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HpcaP84075 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HpcaP84075 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HpcaP84075 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HpcaP84075 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HpcaP84075 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HpcaP84075 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HpcaP84075 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HpcaP84075 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HpcaP84075 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HpcaP84075 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HpcaP84075 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HpcaP84075 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HpcaP84075 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HpcaP84075 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HpcaP84075 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HpcaP84075 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HpcaP84075 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HpcaP84075 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
HpcaP84075 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HpcaP84075 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HpcaP84075 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HpcaP84075 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HpcaP84075 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HpcaP84075 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HpcaP84075 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HpcaP84075 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HpcaP84075 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HpcaP84075 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HpcaP84075 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HpcaP84075 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HpcaP84075 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HpcaP84075 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HpcaP84075 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HpcaP84075 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HpcaP84075 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HpcaP84075 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HpcaP84075 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HpcaP84075 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HpcaP84075 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HpcaP84075 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HpcaP84075 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HpcaP84075 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HpcaP84075 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HpcaP84075 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HpcaP84075 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HpcaP84075 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HpcaP84075 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HpcaP84075 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
HpcaP84075 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HpcaP84075 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HpcaP84075 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HpcaP84075 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms