Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Irx2P81066 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Irx2P81066 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Irx2P81066 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Irx2P81066 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Irx2P81066 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Irx2P81066 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Irx2P81066 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Irx2P81066 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Irx2P81066 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Irx2P81066 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Irx2P81066 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Irx2P81066 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Irx2P81066 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Irx2P81066 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Irx2P81066 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Irx2P81066 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Irx2P81066 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Irx2P81066 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Irx2P81066 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Irx2P81066 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Irx2P81066 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Irx2P81066 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Irx2P81066 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Irx2P81066 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Irx2P81066 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Irx2P81066 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Irx2P81066 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Irx2P81066 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Irx2P81066 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Irx2P81066 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Irx2P81066 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Irx2P81066 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Irx2P81066 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Irx2P81066 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Irx2P81066 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Irx2P81066 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Irx2P81066 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Irx2P81066 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Irx2P81066 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Irx2P81066 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Irx2P81066 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Irx2P81066 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Irx2P81066 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Irx2P81066 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Irx2P81066 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Irx2P81066 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Irx2P81066 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Irx2P81066 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Irx2P81066 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Irx2P81066 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Irx2P81066 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Irx2P81066 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Irx2P81066 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Irx2P81066 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Irx2P81066 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Irx2P81066 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Irx2P81066 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Irx2P81066 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Irx2P81066 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Irx2P81066 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Irx2P81066 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Irx2P81066 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Irx2P81066 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Irx2P81066 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Irx2P81066 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Irx2P81066 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Irx2P81066 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Irx2P81066 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Irx2P81066 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Irx2P81066 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Irx2P81066 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Irx2P81066 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Irx2P81066 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Irx2P81066 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Irx2P81066 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Irx2P81066 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Irx2P81066 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Irx2P81066 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Irx2P81066 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Irx2P81066 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Irx2P81066 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Irx2P81066 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Irx2P81066 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Irx2P81066 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Irx2P81066 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Irx2P81066 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Irx2P81066 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Irx2P81066 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Irx2P81066 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Irx2P81066 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Irx2P81066 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Irx2P81066 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Irx2P81066 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Irx2P81066 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Irx2P81066 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Irx2P81066 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Irx2P81066 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Irx2P81066 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Irx2P81066 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms