Protein–RNA interactions for Protein: P78357

CNTNAP1, Contactin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP1P78357 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CNTNAP1P78357 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
CNTNAP1P78357 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
CNTNAP1P78357 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CNTNAP1P78357 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CNTNAP1P78357 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CNTNAP1P78357 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CNTNAP1P78357 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CNTNAP1P78357 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CNTNAP1P78357 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CNTNAP1P78357 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
CNTNAP1P78357 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CNTNAP1P78357 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CNTNAP1P78357 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CNTNAP1P78357 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CNTNAP1P78357 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CNTNAP1P78357 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CNTNAP1P78357 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CNTNAP1P78357 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CNTNAP1P78357 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CNTNAP1P78357 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CNTNAP1P78357 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CNTNAP1P78357 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CNTNAP1P78357 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CNTNAP1P78357 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CNTNAP1P78357 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CNTNAP1P78357 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CNTNAP1P78357 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CNTNAP1P78357 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CNTNAP1P78357 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CNTNAP1P78357 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CNTNAP1P78357 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CNTNAP1P78357 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
CNTNAP1P78357 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CNTNAP1P78357 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CNTNAP1P78357 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CNTNAP1P78357 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CNTNAP1P78357 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CNTNAP1P78357 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC32.95■■■□□ 2.86
CNTNAP1P78357 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.86
CNTNAP1P78357 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.86
CNTNAP1P78357 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
CNTNAP1P78357 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CNTNAP1P78357 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CNTNAP1P78357 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CNTNAP1P78357 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CNTNAP1P78357 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CNTNAP1P78357 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CNTNAP1P78357 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
CNTNAP1P78357 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
CNTNAP1P78357 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
CNTNAP1P78357 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
CNTNAP1P78357 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CNTNAP1P78357 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CNTNAP1P78357 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
CNTNAP1P78357 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CNTNAP1P78357 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CNTNAP1P78357 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CNTNAP1P78357 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
CNTNAP1P78357 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CNTNAP1P78357 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CNTNAP1P78357 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CNTNAP1P78357 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
CNTNAP1P78357 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
CNTNAP1P78357 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
CNTNAP1P78357 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CNTNAP1P78357 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
CNTNAP1P78357 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CNTNAP1P78357 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CNTNAP1P78357 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CNTNAP1P78357 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
CNTNAP1P78357 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.82
CNTNAP1P78357 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CNTNAP1P78357 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CNTNAP1P78357 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CNTNAP1P78357 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CNTNAP1P78357 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CNTNAP1P78357 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CNTNAP1P78357 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CNTNAP1P78357 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CNTNAP1P78357 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CNTNAP1P78357 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CNTNAP1P78357 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CNTNAP1P78357 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CNTNAP1P78357 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CNTNAP1P78357 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CNTNAP1P78357 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CNTNAP1P78357 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
CNTNAP1P78357 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CNTNAP1P78357 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CNTNAP1P78357 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CNTNAP1P78357 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CNTNAP1P78357 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CNTNAP1P78357 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CNTNAP1P78357 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
CNTNAP1P78357 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CNTNAP1P78357 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CNTNAP1P78357 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CNTNAP1P78357 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CNTNAP1P78357 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms