Protein–RNA interactions for Protein: P78329

CYP4F2, Phylloquinone omega-hydroxylase CYP4F2, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F2P78329 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CYP4F2P78329 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CYP4F2P78329 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CYP4F2P78329 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CYP4F2P78329 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CYP4F2P78329 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CYP4F2P78329 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CYP4F2P78329 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CYP4F2P78329 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CYP4F2P78329 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CYP4F2P78329 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CYP4F2P78329 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CYP4F2P78329 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CYP4F2P78329 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CYP4F2P78329 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CYP4F2P78329 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CYP4F2P78329 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CYP4F2P78329 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CYP4F2P78329 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CYP4F2P78329 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CYP4F2P78329 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CYP4F2P78329 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CYP4F2P78329 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CYP4F2P78329 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CYP4F2P78329 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CYP4F2P78329 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CYP4F2P78329 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CYP4F2P78329 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CYP4F2P78329 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CYP4F2P78329 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CYP4F2P78329 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CYP4F2P78329 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CYP4F2P78329 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CYP4F2P78329 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CYP4F2P78329 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CYP4F2P78329 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CYP4F2P78329 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CYP4F2P78329 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CYP4F2P78329 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CYP4F2P78329 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CYP4F2P78329 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CYP4F2P78329 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CYP4F2P78329 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CYP4F2P78329 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CYP4F2P78329 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CYP4F2P78329 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CYP4F2P78329 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CYP4F2P78329 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CYP4F2P78329 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CYP4F2P78329 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CYP4F2P78329 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CYP4F2P78329 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CYP4F2P78329 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CYP4F2P78329 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CYP4F2P78329 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CYP4F2P78329 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CYP4F2P78329 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CYP4F2P78329 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CYP4F2P78329 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CYP4F2P78329 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CYP4F2P78329 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CYP4F2P78329 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CYP4F2P78329 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CYP4F2P78329 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CYP4F2P78329 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CYP4F2P78329 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CYP4F2P78329 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CYP4F2P78329 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CYP4F2P78329 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CYP4F2P78329 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CYP4F2P78329 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CYP4F2P78329 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CYP4F2P78329 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CYP4F2P78329 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CYP4F2P78329 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CYP4F2P78329 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CYP4F2P78329 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CYP4F2P78329 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CYP4F2P78329 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CYP4F2P78329 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CYP4F2P78329 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CYP4F2P78329 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CYP4F2P78329 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CYP4F2P78329 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CYP4F2P78329 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CYP4F2P78329 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CYP4F2P78329 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CYP4F2P78329 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CYP4F2P78329 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CYP4F2P78329 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CYP4F2P78329 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CYP4F2P78329 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CYP4F2P78329 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CYP4F2P78329 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CYP4F2P78329 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CYP4F2P78329 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CYP4F2P78329 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CYP4F2P78329 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CYP4F2P78329 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CYP4F2P78329 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms