Protein–RNA interactions for Protein: P70390

Shox2, Short stature homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shox2P70390 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Shox2P70390 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Shox2P70390 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Shox2P70390 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Shox2P70390 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Shox2P70390 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Shox2P70390 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Shox2P70390 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Shox2P70390 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Shox2P70390 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Shox2P70390 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Shox2P70390 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Shox2P70390 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Shox2P70390 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Shox2P70390 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Shox2P70390 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Shox2P70390 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Shox2P70390 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Shox2P70390 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Shox2P70390 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Shox2P70390 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Shox2P70390 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Shox2P70390 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Shox2P70390 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Shox2P70390 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Shox2P70390 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Shox2P70390 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Shox2P70390 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Shox2P70390 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Shox2P70390 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Shox2P70390 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Shox2P70390 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Shox2P70390 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Shox2P70390 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Shox2P70390 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Shox2P70390 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Shox2P70390 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Shox2P70390 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Shox2P70390 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Shox2P70390 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Shox2P70390 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Shox2P70390 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Shox2P70390 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Shox2P70390 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Shox2P70390 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Shox2P70390 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Shox2P70390 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Shox2P70390 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Shox2P70390 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Shox2P70390 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Shox2P70390 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Shox2P70390 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Shox2P70390 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Shox2P70390 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Shox2P70390 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Shox2P70390 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Shox2P70390 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Shox2P70390 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Shox2P70390 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Shox2P70390 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Shox2P70390 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Shox2P70390 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Shox2P70390 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Shox2P70390 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Shox2P70390 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Shox2P70390 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Shox2P70390 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Shox2P70390 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Shox2P70390 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Shox2P70390 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Shox2P70390 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Shox2P70390 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Shox2P70390 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Shox2P70390 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Shox2P70390 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Shox2P70390 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Shox2P70390 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Shox2P70390 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Shox2P70390 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Shox2P70390 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Shox2P70390 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Shox2P70390 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Shox2P70390 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Shox2P70390 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Shox2P70390 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Shox2P70390 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Shox2P70390 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Shox2P70390 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Shox2P70390 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Shox2P70390 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Shox2P70390 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Shox2P70390 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Shox2P70390 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Shox2P70390 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Shox2P70390 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Shox2P70390 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Shox2P70390 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Shox2P70390 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Shox2P70390 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Shox2P70390 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms