Protein–RNA interactions for Protein: P70339

Frat1, Proto-oncogene FRAT1, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frat1P70339 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Frat1P70339 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Frat1P70339 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Frat1P70339 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Frat1P70339 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Frat1P70339 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Frat1P70339 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Frat1P70339 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Frat1P70339 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Frat1P70339 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Frat1P70339 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Frat1P70339 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Frat1P70339 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Frat1P70339 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Frat1P70339 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Frat1P70339 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Frat1P70339 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Frat1P70339 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Frat1P70339 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Frat1P70339 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Frat1P70339 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Frat1P70339 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Frat1P70339 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Frat1P70339 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Frat1P70339 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Frat1P70339 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Frat1P70339 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Frat1P70339 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Frat1P70339 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Frat1P70339 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Frat1P70339 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Frat1P70339 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Frat1P70339 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Frat1P70339 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Frat1P70339 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Frat1P70339 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Frat1P70339 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Frat1P70339 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Frat1P70339 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Frat1P70339 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Frat1P70339 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Frat1P70339 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Frat1P70339 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Frat1P70339 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Frat1P70339 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Frat1P70339 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Frat1P70339 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Frat1P70339 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Frat1P70339 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Frat1P70339 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Frat1P70339 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Frat1P70339 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Frat1P70339 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Frat1P70339 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Frat1P70339 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Frat1P70339 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Frat1P70339 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Frat1P70339 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Frat1P70339 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Frat1P70339 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Frat1P70339 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Frat1P70339 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Frat1P70339 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Frat1P70339 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Frat1P70339 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Frat1P70339 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Frat1P70339 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Frat1P70339 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Frat1P70339 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Frat1P70339 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Frat1P70339 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Frat1P70339 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Frat1P70339 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Frat1P70339 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Frat1P70339 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Frat1P70339 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Frat1P70339 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Frat1P70339 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Frat1P70339 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Frat1P70339 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Frat1P70339 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Frat1P70339 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Frat1P70339 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Frat1P70339 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Frat1P70339 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Frat1P70339 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Frat1P70339 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Frat1P70339 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Frat1P70339 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Frat1P70339 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Frat1P70339 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Frat1P70339 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Frat1P70339 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Frat1P70339 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Frat1P70339 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Frat1P70339 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Frat1P70339 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Frat1P70339 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Frat1P70339 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Frat1P70339 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.3 ms