Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Chl1P70232 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
Chl1P70232 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Chl1P70232 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Chl1P70232 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Chl1P70232 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Chl1P70232 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Chl1P70232 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Chl1P70232 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Chl1P70232 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Chl1P70232 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Chl1P70232 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Chl1P70232 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Chl1P70232 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Chl1P70232 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Chl1P70232 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Chl1P70232 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Chl1P70232 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Chl1P70232 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Chl1P70232 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
Chl1P70232 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
Chl1P70232 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Chl1P70232 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Chl1P70232 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Chl1P70232 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
Chl1P70232 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Chl1P70232 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Chl1P70232 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Chl1P70232 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Chl1P70232 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Chl1P70232 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Chl1P70232 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Chl1P70232 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Chl1P70232 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Chl1P70232 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Chl1P70232 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Chl1P70232 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Chl1P70232 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
Chl1P70232 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Chl1P70232 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Chl1P70232 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Chl1P70232 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Chl1P70232 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Chl1P70232 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Chl1P70232 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Chl1P70232 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Chl1P70232 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Chl1P70232 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Chl1P70232 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
Chl1P70232 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Chl1P70232 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Chl1P70232 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Chl1P70232 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Chl1P70232 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Chl1P70232 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Chl1P70232 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Chl1P70232 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Chl1P70232 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Chl1P70232 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Chl1P70232 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Chl1P70232 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Chl1P70232 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Chl1P70232 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Chl1P70232 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Chl1P70232 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Chl1P70232 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Chl1P70232 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Chl1P70232 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Chl1P70232 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC32■■■□□ 2.71
Chl1P70232 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Chl1P70232 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Chl1P70232 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Chl1P70232 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Chl1P70232 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Chl1P70232 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC31.95■■■□□ 2.7
Chl1P70232 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Chl1P70232 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Chl1P70232 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Chl1P70232 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Chl1P70232 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Chl1P70232 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Chl1P70232 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Chl1P70232 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Chl1P70232 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Chl1P70232 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Chl1P70232 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Chl1P70232 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Chl1P70232 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
Chl1P70232 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Chl1P70232 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
Chl1P70232 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Chl1P70232 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Chl1P70232 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Chl1P70232 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Chl1P70232 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Chl1P70232 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Chl1P70232 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Chl1P70232 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.69
Chl1P70232 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Chl1P70232 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms