Protein–RNA interactions for Protein: P68181

Prkacb, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkacbP68181 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PrkacbP68181 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PrkacbP68181 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PrkacbP68181 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PrkacbP68181 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PrkacbP68181 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PrkacbP68181 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PrkacbP68181 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PrkacbP68181 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PrkacbP68181 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PrkacbP68181 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PrkacbP68181 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PrkacbP68181 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PrkacbP68181 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PrkacbP68181 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PrkacbP68181 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PrkacbP68181 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PrkacbP68181 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PrkacbP68181 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PrkacbP68181 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PrkacbP68181 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PrkacbP68181 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PrkacbP68181 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PrkacbP68181 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PrkacbP68181 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PrkacbP68181 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PrkacbP68181 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PrkacbP68181 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PrkacbP68181 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PrkacbP68181 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PrkacbP68181 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PrkacbP68181 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PrkacbP68181 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PrkacbP68181 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PrkacbP68181 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PrkacbP68181 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PrkacbP68181 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PrkacbP68181 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PrkacbP68181 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PrkacbP68181 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrkacbP68181 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PrkacbP68181 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PrkacbP68181 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PrkacbP68181 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PrkacbP68181 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PrkacbP68181 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrkacbP68181 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrkacbP68181 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrkacbP68181 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PrkacbP68181 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PrkacbP68181 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrkacbP68181 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PrkacbP68181 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PrkacbP68181 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PrkacbP68181 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PrkacbP68181 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrkacbP68181 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrkacbP68181 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrkacbP68181 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrkacbP68181 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrkacbP68181 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrkacbP68181 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PrkacbP68181 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PrkacbP68181 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PrkacbP68181 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PrkacbP68181 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PrkacbP68181 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PrkacbP68181 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PrkacbP68181 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PrkacbP68181 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PrkacbP68181 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PrkacbP68181 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PrkacbP68181 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrkacbP68181 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PrkacbP68181 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrkacbP68181 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrkacbP68181 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PrkacbP68181 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrkacbP68181 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PrkacbP68181 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PrkacbP68181 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PrkacbP68181 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PrkacbP68181 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrkacbP68181 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PrkacbP68181 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrkacbP68181 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PrkacbP68181 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PrkacbP68181 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrkacbP68181 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrkacbP68181 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrkacbP68181 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrkacbP68181 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrkacbP68181 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrkacbP68181 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrkacbP68181 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrkacbP68181 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrkacbP68181 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PrkacbP68181 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PrkacbP68181 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PrkacbP68181 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms