Protein–RNA interactions for Protein: P63268

Actg2, Actin, gamma-enteric smooth muscle, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actg2P63268 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Actg2P63268 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Actg2P63268 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Actg2P63268 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Actg2P63268 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Actg2P63268 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Actg2P63268 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Actg2P63268 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Actg2P63268 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Actg2P63268 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Actg2P63268 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Actg2P63268 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Actg2P63268 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Actg2P63268 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Actg2P63268 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Actg2P63268 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Actg2P63268 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Actg2P63268 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Actg2P63268 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Actg2P63268 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Actg2P63268 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Actg2P63268 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Actg2P63268 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Actg2P63268 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Actg2P63268 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Actg2P63268 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Actg2P63268 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Actg2P63268 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Actg2P63268 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Actg2P63268 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Actg2P63268 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Actg2P63268 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Actg2P63268 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Actg2P63268 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Actg2P63268 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Actg2P63268 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Actg2P63268 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Actg2P63268 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Actg2P63268 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Actg2P63268 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Actg2P63268 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Actg2P63268 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Actg2P63268 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Actg2P63268 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Actg2P63268 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Actg2P63268 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Actg2P63268 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Actg2P63268 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Actg2P63268 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Actg2P63268 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Actg2P63268 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Actg2P63268 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Actg2P63268 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Actg2P63268 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Actg2P63268 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Actg2P63268 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Actg2P63268 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Actg2P63268 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Actg2P63268 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Actg2P63268 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Actg2P63268 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Actg2P63268 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Actg2P63268 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Actg2P63268 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Actg2P63268 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Actg2P63268 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Actg2P63268 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Actg2P63268 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Actg2P63268 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Actg2P63268 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Actg2P63268 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Actg2P63268 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Actg2P63268 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Actg2P63268 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Actg2P63268 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Actg2P63268 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Actg2P63268 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Actg2P63268 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Actg2P63268 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Actg2P63268 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Actg2P63268 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Actg2P63268 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Actg2P63268 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Actg2P63268 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Actg2P63268 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Actg2P63268 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Actg2P63268 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Actg2P63268 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Actg2P63268 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Actg2P63268 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Actg2P63268 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Actg2P63268 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Actg2P63268 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Actg2P63268 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Actg2P63268 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Actg2P63268 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Actg2P63268 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Actg2P63268 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Actg2P63268 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Actg2P63268 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms