Protein–RNA interactions for Protein: P63058

Thra, Thyroid hormone receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThraP63058 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ThraP63058 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ThraP63058 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ThraP63058 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ThraP63058 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ThraP63058 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ThraP63058 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ThraP63058 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ThraP63058 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ThraP63058 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ThraP63058 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ThraP63058 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ThraP63058 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ThraP63058 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ThraP63058 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ThraP63058 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ThraP63058 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ThraP63058 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ThraP63058 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ThraP63058 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ThraP63058 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ThraP63058 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ThraP63058 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ThraP63058 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ThraP63058 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ThraP63058 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ThraP63058 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ThraP63058 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ThraP63058 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ThraP63058 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ThraP63058 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ThraP63058 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ThraP63058 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ThraP63058 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ThraP63058 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ThraP63058 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ThraP63058 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ThraP63058 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ThraP63058 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ThraP63058 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ThraP63058 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ThraP63058 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ThraP63058 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ThraP63058 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ThraP63058 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ThraP63058 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ThraP63058 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ThraP63058 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ThraP63058 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ThraP63058 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ThraP63058 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ThraP63058 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ThraP63058 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ThraP63058 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ThraP63058 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ThraP63058 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ThraP63058 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ThraP63058 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ThraP63058 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ThraP63058 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ThraP63058 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ThraP63058 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ThraP63058 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ThraP63058 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ThraP63058 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ThraP63058 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ThraP63058 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ThraP63058 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ThraP63058 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ThraP63058 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ThraP63058 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ThraP63058 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ThraP63058 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ThraP63058 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ThraP63058 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ThraP63058 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ThraP63058 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ThraP63058 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ThraP63058 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ThraP63058 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ThraP63058 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ThraP63058 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ThraP63058 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ThraP63058 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ThraP63058 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ThraP63058 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ThraP63058 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ThraP63058 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ThraP63058 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ThraP63058 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ThraP63058 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ThraP63058 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ThraP63058 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ThraP63058 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ThraP63058 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ThraP63058 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ThraP63058 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ThraP63058 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ThraP63058 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ThraP63058 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms