Protein–RNA interactions for Protein: P62869

Elob, Elongin-B, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ElobP62869 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ElobP62869 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ElobP62869 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ElobP62869 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ElobP62869 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ElobP62869 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ElobP62869 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ElobP62869 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ElobP62869 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ElobP62869 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ElobP62869 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ElobP62869 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ElobP62869 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ElobP62869 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ElobP62869 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ElobP62869 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ElobP62869 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ElobP62869 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
ElobP62869 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ElobP62869 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ElobP62869 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ElobP62869 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ElobP62869 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ElobP62869 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ElobP62869 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ElobP62869 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ElobP62869 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ElobP62869 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ElobP62869 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ElobP62869 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ElobP62869 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ElobP62869 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ElobP62869 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ElobP62869 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ElobP62869 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ElobP62869 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ElobP62869 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ElobP62869 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ElobP62869 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ElobP62869 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ElobP62869 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ElobP62869 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ElobP62869 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ElobP62869 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ElobP62869 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ElobP62869 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ElobP62869 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ElobP62869 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ElobP62869 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ElobP62869 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ElobP62869 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ElobP62869 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ElobP62869 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ElobP62869 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ElobP62869 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ElobP62869 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ElobP62869 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ElobP62869 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ElobP62869 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ElobP62869 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ElobP62869 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ElobP62869 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ElobP62869 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ElobP62869 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ElobP62869 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ElobP62869 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ElobP62869 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ElobP62869 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ElobP62869 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ElobP62869 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ElobP62869 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ElobP62869 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ElobP62869 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ElobP62869 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ElobP62869 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ElobP62869 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ElobP62869 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ElobP62869 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ElobP62869 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ElobP62869 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ElobP62869 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ElobP62869 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ElobP62869 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ElobP62869 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ElobP62869 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ElobP62869 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ElobP62869 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ElobP62869 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ElobP62869 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ElobP62869 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ElobP62869 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ElobP62869 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ElobP62869 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
ElobP62869 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ElobP62869 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ElobP62869 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ElobP62869 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ElobP62869 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ElobP62869 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ElobP62869 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms