Protein–RNA interactions for Protein: P62491

RAB11A, Ras-related protein Rab-11A, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11AP62491 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB11AP62491 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB11AP62491 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB11AP62491 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB11AP62491 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB11AP62491 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB11AP62491 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB11AP62491 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB11AP62491 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB11AP62491 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB11AP62491 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB11AP62491 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB11AP62491 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB11AP62491 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB11AP62491 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB11AP62491 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB11AP62491 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB11AP62491 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB11AP62491 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB11AP62491 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB11AP62491 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB11AP62491 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB11AP62491 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB11AP62491 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB11AP62491 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB11AP62491 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB11AP62491 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB11AP62491 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB11AP62491 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB11AP62491 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB11AP62491 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB11AP62491 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB11AP62491 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB11AP62491 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB11AP62491 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB11AP62491 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB11AP62491 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB11AP62491 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB11AP62491 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB11AP62491 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB11AP62491 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB11AP62491 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB11AP62491 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB11AP62491 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB11AP62491 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB11AP62491 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB11AP62491 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB11AP62491 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB11AP62491 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB11AP62491 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB11AP62491 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB11AP62491 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB11AP62491 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB11AP62491 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB11AP62491 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB11AP62491 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB11AP62491 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB11AP62491 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB11AP62491 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB11AP62491 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB11AP62491 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB11AP62491 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB11AP62491 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB11AP62491 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB11AP62491 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB11AP62491 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB11AP62491 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB11AP62491 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB11AP62491 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB11AP62491 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB11AP62491 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB11AP62491 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB11AP62491 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB11AP62491 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB11AP62491 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB11AP62491 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB11AP62491 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB11AP62491 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB11AP62491 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB11AP62491 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB11AP62491 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB11AP62491 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB11AP62491 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB11AP62491 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB11AP62491 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB11AP62491 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB11AP62491 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB11AP62491 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB11AP62491 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB11AP62491 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB11AP62491 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB11AP62491 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB11AP62491 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB11AP62491 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB11AP62491 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB11AP62491 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB11AP62491 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB11AP62491 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB11AP62491 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB11AP62491 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms