Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vbp1P61759 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vbp1P61759 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vbp1P61759 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vbp1P61759 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vbp1P61759 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vbp1P61759 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vbp1P61759 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vbp1P61759 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vbp1P61759 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vbp1P61759 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vbp1P61759 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vbp1P61759 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vbp1P61759 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vbp1P61759 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vbp1P61759 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vbp1P61759 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vbp1P61759 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vbp1P61759 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vbp1P61759 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vbp1P61759 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vbp1P61759 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vbp1P61759 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vbp1P61759 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vbp1P61759 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vbp1P61759 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vbp1P61759 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vbp1P61759 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vbp1P61759 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vbp1P61759 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vbp1P61759 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vbp1P61759 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vbp1P61759 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vbp1P61759 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vbp1P61759 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vbp1P61759 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vbp1P61759 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Vbp1P61759 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vbp1P61759 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vbp1P61759 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vbp1P61759 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vbp1P61759 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vbp1P61759 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vbp1P61759 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vbp1P61759 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Vbp1P61759 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vbp1P61759 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vbp1P61759 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vbp1P61759 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vbp1P61759 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vbp1P61759 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vbp1P61759 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vbp1P61759 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vbp1P61759 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vbp1P61759 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vbp1P61759 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vbp1P61759 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vbp1P61759 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vbp1P61759 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vbp1P61759 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vbp1P61759 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vbp1P61759 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vbp1P61759 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vbp1P61759 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vbp1P61759 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vbp1P61759 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vbp1P61759 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vbp1P61759 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vbp1P61759 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vbp1P61759 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vbp1P61759 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vbp1P61759 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vbp1P61759 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vbp1P61759 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vbp1P61759 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vbp1P61759 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vbp1P61759 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Vbp1P61759 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vbp1P61759 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vbp1P61759 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vbp1P61759 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vbp1P61759 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vbp1P61759 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vbp1P61759 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vbp1P61759 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Vbp1P61759 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vbp1P61759 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vbp1P61759 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vbp1P61759 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vbp1P61759 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vbp1P61759 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vbp1P61759 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vbp1P61759 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vbp1P61759 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vbp1P61759 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vbp1P61759 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vbp1P61759 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vbp1P61759 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vbp1P61759 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vbp1P61759 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms