Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Itga11P61622 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Itga11P61622 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Itga11P61622 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Itga11P61622 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Itga11P61622 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Itga11P61622 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Itga11P61622 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Itga11P61622 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Itga11P61622 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Itga11P61622 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Itga11P61622 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Itga11P61622 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Itga11P61622 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Itga11P61622 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Itga11P61622 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Itga11P61622 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Itga11P61622 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Itga11P61622 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Itga11P61622 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Itga11P61622 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Itga11P61622 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Itga11P61622 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Itga11P61622 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Itga11P61622 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Itga11P61622 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Itga11P61622 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Itga11P61622 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Itga11P61622 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Itga11P61622 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Itga11P61622 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Itga11P61622 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Itga11P61622 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Itga11P61622 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Itga11P61622 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Itga11P61622 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Itga11P61622 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Itga11P61622 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Itga11P61622 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Itga11P61622 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Itga11P61622 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Itga11P61622 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Itga11P61622 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Itga11P61622 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Itga11P61622 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Itga11P61622 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Itga11P61622 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Itga11P61622 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Itga11P61622 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Itga11P61622 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Itga11P61622 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Itga11P61622 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Itga11P61622 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Itga11P61622 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Itga11P61622 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Itga11P61622 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Itga11P61622 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Itga11P61622 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Itga11P61622 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Itga11P61622 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Itga11P61622 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Itga11P61622 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Itga11P61622 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Itga11P61622 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Itga11P61622 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Itga11P61622 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Itga11P61622 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Itga11P61622 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Itga11P61622 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Itga11P61622 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Itga11P61622 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Itga11P61622 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Itga11P61622 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Itga11P61622 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Itga11P61622 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Itga11P61622 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Itga11P61622 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Itga11P61622 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Itga11P61622 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Itga11P61622 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Itga11P61622 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Itga11P61622 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Itga11P61622 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Itga11P61622 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Itga11P61622 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Itga11P61622 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Itga11P61622 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Itga11P61622 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Itga11P61622 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Itga11P61622 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Itga11P61622 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Itga11P61622 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Itga11P61622 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Itga11P61622 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Itga11P61622 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Itga11P61622 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Itga11P61622 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Itga11P61622 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Itga11P61622 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Itga11P61622 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms