Protein–RNA interactions for Protein: P61601

NCALD, Neurocalcin-delta, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCALDP61601 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NCALDP61601 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NCALDP61601 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NCALDP61601 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NCALDP61601 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NCALDP61601 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NCALDP61601 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NCALDP61601 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NCALDP61601 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NCALDP61601 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NCALDP61601 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NCALDP61601 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NCALDP61601 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NCALDP61601 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NCALDP61601 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NCALDP61601 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NCALDP61601 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NCALDP61601 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NCALDP61601 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NCALDP61601 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NCALDP61601 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NCALDP61601 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
NCALDP61601 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NCALDP61601 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NCALDP61601 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NCALDP61601 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NCALDP61601 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NCALDP61601 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NCALDP61601 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NCALDP61601 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NCALDP61601 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NCALDP61601 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NCALDP61601 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NCALDP61601 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NCALDP61601 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NCALDP61601 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NCALDP61601 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NCALDP61601 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NCALDP61601 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NCALDP61601 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NCALDP61601 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NCALDP61601 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NCALDP61601 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NCALDP61601 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NCALDP61601 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NCALDP61601 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NCALDP61601 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NCALDP61601 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NCALDP61601 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NCALDP61601 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NCALDP61601 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
NCALDP61601 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NCALDP61601 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NCALDP61601 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NCALDP61601 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NCALDP61601 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NCALDP61601 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NCALDP61601 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NCALDP61601 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NCALDP61601 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NCALDP61601 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NCALDP61601 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
NCALDP61601 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NCALDP61601 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
NCALDP61601 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NCALDP61601 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NCALDP61601 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NCALDP61601 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NCALDP61601 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
NCALDP61601 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NCALDP61601 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NCALDP61601 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NCALDP61601 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NCALDP61601 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NCALDP61601 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NCALDP61601 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NCALDP61601 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NCALDP61601 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NCALDP61601 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NCALDP61601 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NCALDP61601 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NCALDP61601 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NCALDP61601 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NCALDP61601 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NCALDP61601 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NCALDP61601 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NCALDP61601 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NCALDP61601 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NCALDP61601 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NCALDP61601 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NCALDP61601 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NCALDP61601 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NCALDP61601 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NCALDP61601 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NCALDP61601 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NCALDP61601 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NCALDP61601 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NCALDP61601 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NCALDP61601 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NCALDP61601 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms