Protein–RNA interactions for Protein: P61587

RND3, Rho-related GTP-binding protein RhoE, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RND3P61587 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RND3P61587 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RND3P61587 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RND3P61587 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RND3P61587 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RND3P61587 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RND3P61587 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RND3P61587 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RND3P61587 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RND3P61587 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RND3P61587 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RND3P61587 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RND3P61587 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RND3P61587 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RND3P61587 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RND3P61587 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RND3P61587 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RND3P61587 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RND3P61587 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RND3P61587 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RND3P61587 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RND3P61587 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RND3P61587 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RND3P61587 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RND3P61587 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RND3P61587 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RND3P61587 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RND3P61587 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RND3P61587 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RND3P61587 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RND3P61587 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RND3P61587 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RND3P61587 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RND3P61587 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RND3P61587 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RND3P61587 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RND3P61587 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RND3P61587 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RND3P61587 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RND3P61587 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RND3P61587 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RND3P61587 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RND3P61587 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RND3P61587 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RND3P61587 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RND3P61587 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RND3P61587 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RND3P61587 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RND3P61587 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RND3P61587 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RND3P61587 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RND3P61587 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RND3P61587 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RND3P61587 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RND3P61587 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RND3P61587 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RND3P61587 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RND3P61587 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RND3P61587 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RND3P61587 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RND3P61587 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RND3P61587 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RND3P61587 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RND3P61587 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RND3P61587 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RND3P61587 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RND3P61587 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RND3P61587 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RND3P61587 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RND3P61587 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RND3P61587 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RND3P61587 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RND3P61587 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RND3P61587 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RND3P61587 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RND3P61587 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RND3P61587 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RND3P61587 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RND3P61587 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RND3P61587 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RND3P61587 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RND3P61587 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RND3P61587 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RND3P61587 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RND3P61587 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RND3P61587 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RND3P61587 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RND3P61587 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RND3P61587 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RND3P61587 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RND3P61587 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RND3P61587 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RND3P61587 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RND3P61587 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RND3P61587 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RND3P61587 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RND3P61587 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RND3P61587 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RND3P61587 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RND3P61587 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms